RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521945.1

SFTA3-210, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SFTA3, Length 1,116 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-210ENST00000521945 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 H7BY64 318 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 CCDC188H7C350 402 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 TIPRLO75663 272 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 TGFAP01135 160 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 SOD3P08294 240 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 KDELR1P24390 212 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 FPR2P25090 351 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 FMO4P31512 558 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 CDKN2BP42772 138 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 MAGEA5P43359 124 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 HLCSP50747 726 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 CCR8P51685 355 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 DPYSL3Q14195 570 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 CYP1B1Q16678 543 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 CDO1Q16878 200 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 SEL1L2Q5TEA6 688 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 SLC9A4Q6AI14 798 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 LANCL3Q6ZV70 420 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 BBS12Q6ZW61 710 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 CCDC185Q8N715 623 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 CEP112Q8N8E3 955 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 M1APQ8TC57 530 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 VPS11Q9H270 941 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 EXO5Q9H790 373 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 DEPPQ9NTK1 212 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 X6R8D5 127 aa6.96□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 A0A0J9YY10 115 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 CDC7O00311 574 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 ATP6AP2O75787 350 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 TJP3O95049 919 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 NAT1P18440 290 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 PAFAH1B1P43034 410 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 LIMS1P48059 325 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 TAS2R50P59544 299 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 MAXP61244 160 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 BTKQ06187 659 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 FAM27E3Q08E93 113 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 SLC10A7Q0GE19 358 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 FAPQ12884 760 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 DPYSQ14117 519 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 TFDP2Q14188 446 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 EXT1Q16394 746 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 MFSD7Q6UXD7 560 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 SH2D5Q6ZV89 423 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 LACC1Q8IV20 430 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 PGBD5Q8N414 524 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 MNS1Q8NEH6 495 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 MRAPQ8TCY5 172 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 METTL21AQ8WXB1 218 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 RAPGEF5Q92565 580 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-210ENST00000521945 BTBD9Q96Q07 612 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms