RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TAP2Q03519 686 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 ILKQ13418 452 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 MADCAM1Q13477 382 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 GRIN2CQ14957 1233 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 CASP12Q6UXS9 341 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 RAB43Q86YS6 212 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TMC8Q8IU68 726 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 IQCF1Q8N6M8 205 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 SETD6Q8TBK2 473 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TMEM203Q969S6 136 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 PDXPQ96GD0 296 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 SEC14L4Q9UDX3 406 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TNNI3P19429 210 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 UQCRC2P22695 453 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 XKP51811 444 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 RUNX1T1Q06455 604 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 SLAMF1Q13291 335 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 ZFP69Q49AA0 526 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 DCST1Q5T197 706 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC39A11Q8N1S5 342 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TMEM19Q96HH6 336 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 PHOX2BQ99453 314 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TSSK6Q9BXA6 273 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 SRRQ9GZT4 340 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 C5AR2Q9P296 337 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 STUB1Q9UNE7 303 aa20.48■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 PNLIPRP1P54315 467 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TRIM60Q495X7 471 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 PHC2Q8IXK0 858 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 NANOGP1Q8N7R0 232 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF366Q8N895 744 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 OR4D11Q8NGI4 311 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 RAET1EQ8TD07 263 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC5A11Q8WWX8 675 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 MND1Q9BWT6 205 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 NDEL1Q9GZM8 345 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 NDUFB11Q9NX14 153 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 WASH3PC4AMC7 463 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 RTCAO00442 366 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TPST2O60704 377 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 CDRT1O95170 752 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 XPAP23025 273 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 NCF4Q15080 339 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 ERAP2Q6P179 960 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 NXPE4Q6UWF7 544 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 WDR34Q96EX3 536 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 ACAT2Q9BWD1 397 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 SGPP1Q9BX95 441 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa20.47■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 HYKKA2RU49 373 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 MEIOCA2RUB1 952 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM172BPA6NC97 362 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 CLEC2LP0C7M8 214 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 DGKGP49619 791 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TBRG1Q3YBR2 411 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 MEDAGQ5VYS4 303 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 VN1R5Q7Z5H4 357 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 LILRB4Q8NHJ6 448 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF558Q96NG5 402 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TTYH2Q9BSA4 534 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCB9Q9NP78 766 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TVP23BQ9NYZ1 205 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 SMIM30A4D0T7 59 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 SH3BP5O60239 455 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 FHP07954 510 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 ELFN1P0C7U0 828 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC7A13Q8TCU3 470 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 IL17FQ96PD4 163 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 SNX18Q96RF0 628 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 RMI1Q9H9A7 625 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 SSR3Q9UNL2 185 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 CMAHPQ9Y471 501 aa20.46■□□□□ 0.87
TMEM200B-202ENST00000521452 CENPXA8MT69 81 aa20.45■□□□□ 0.86
TMEM200B-202ENST00000521452 TGM5O43548 720 aa20.45■□□□□ 0.86
TMEM200B-202ENST00000521452 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
TMEM200B-202ENST00000521452 INHAP05111 366 aa20.45■□□□□ 0.86
TMEM200B-202ENST00000521452 TMEM201Q5SNT2 666 aa20.45■□□□□ 0.86
TMEM200B-202ENST00000521452 C12orf73Q69YU5 71 aa20.45■□□□□ 0.86
TMEM200B-202ENST00000521452 PGBD2Q6P3X8 592 aa20.45■□□□□ 0.86
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM131AQ6UXB0 335 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms