RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 SPATC1Q76KD6 591 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 P3H2Q8IVL5 708 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 GTF2H4Q92759 462 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 FAM129BQ96TA1 746 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 AIF1LQ9BQI0 150 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 INPP5KQ9BT40 448 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 TANC1Q9C0D5 1861 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 AGAP14A8MT82 685 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 VEGFDO43915 354 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 BRINP1O60477 761 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf105O95561 183 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 CLIC3O95833 236 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 PROS1P07225 676 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 HSD17B1P14061 328 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 HTR1BP28222 390 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 NTSR1P30989 418 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 PNLIPRP1P54315 467 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 PRKAG1P54619 331 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 CLDN8P56748 225 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 PFN3P60673 137 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 BNC1Q01954 994 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 KCNC3Q14003 757 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ZMYND11Q15326 602 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 CARTPTQ16568 116 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 AARDQ4LEZ3 155 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 GALNT10Q86SR1 603 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 CLECL1Q8IZS7 167 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF740Q8NDX6 193 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 OR10G6Q8NH81 332 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 WDR48Q8TAF3 677 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ZDHHC12Q96GR4 267 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 LMLNQ96KR4 655 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 C19orf43Q9BQ61 176 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 OSBPL11Q9BXB4 747 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 SMOXQ9NWM0 555 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 OR52A4PA6NMU1 304 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 GFYI3L273 518 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 B3GALT4O96024 378 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 SERPINA1P01009 418 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ENGP17813 658 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 SOX6P35712 828 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 OPRD1P41143 372 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ACTR1BP42025 376 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 SSR2P43308 183 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 KCNJ5P48544 419 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 TPMTP51580 245 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ACTR1AP61163 376 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 CDK3Q00526 305 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 FOXK2Q01167 660 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 COTL1Q14019 142 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 GK3PQ14409 553 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 CDKL4Q5MAI5 379 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 PNCKQ6P2M8 343 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 PRSS42Q7Z5A4 293 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 OR5AK3PQ8NH89 298 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ST8SIA2Q92186 375 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 SNAPC3Q92966 411 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 PDXPQ96GD0 296 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO10Q9UK96 956 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.5□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ADH1BP00325 375 aa7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 APEHP13798 732 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 DDCP20711 480 aa7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 C5AR1P21730 350 aa7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ATP6V1E1P36543 226 aa7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 TAS2R50P59544 299 aa7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 CTBSQ01459 385 aa7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 COQ5Q5HYK3 327 aa7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 GPR107Q5VW38 600 aa7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF767PQ75MW2 155 aa7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 LACC1Q8IV20 430 aa7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 ATG16L2Q8NAA4 619 aa7.49□□□□□ -1.21
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM145Q8NBT3 493 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms