RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTPRCAPQ14761 206 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS6KA1Q15418 735 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MICAQ29983 383 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF528Q3MIS6 628 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UNC50Q53HI1 259 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACER2Q5QJU3 275 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLHL10Q6JEL2 608 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC27A4Q6P1M0 643 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TATDN1Q6P1N9 297 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR141Q7Z602 305 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TLK2Q86UE8 772 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UNC5CLQ8IV45 518 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF695Q8IW36 515 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF615Q8N8J6 731 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF709Q8N972 641 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCAF4L2Q8NA75 395 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF149Q8NC42 400 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBTB44Q8NCP5 570 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR1K1Q8NGR3 316 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR4F5Q8NH21 305 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC26Q8TAB7 109 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C8orf46Q8TAG6 207 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RDH5Q92781 318 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC35E1Q96K37 410 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LRRC3BQ96PB8 259 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DPEP2Q9H4A9 486 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADGRL4Q9HBW9 690 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIGARQ9NQ88 270 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa0.24□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRAV18A0A075B6X5 111 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A0U1RQS6 177 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM150BA6NC51 233 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GLOD5A6NK44 160 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 USP27XA6NNY8 438 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACSL4O60488 711 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MBD4O95243 580 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PGM3O95394 542 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIMP1P01033 207 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PENKP01210 267 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RETP07949 1114 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SP9P0CG40 484 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC166P0CW27 439 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTPN4P29074 926 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 XCR1P46094 333 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MNAT1P51948 309 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MFAP2P55001 183 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL10RBQ08334 325 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR50Q13585 617 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHRFAM7AQ494W8 412 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ODF2Q5BJF6 829 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF730Q6ZMV8 503 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR49Q8IV35 697 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TC2NQ8N9U0 490 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NAXEQ8NCW5 288 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MYDGFQ969H8 173 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPSB1Q96BD6 273 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BPIFA2Q96DR5 249 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C10orf88Q9H8K7 445 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDE7BQ9NP56 450 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TBC1D22BQ9NU19 505 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MED17Q9NVC6 651 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TAS2R16Q9NYV7 291 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCPG1Q9ULG6 757 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CACNG2Q9Y698 323 aa0.23□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa0.22□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COLCA2A8K830 154 aa0.22□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM166BA8MTA8 275 aa0.22□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF212BA8MTL3 300 aa0.22□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMCO5BA8MYB1 307 aa0.22□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 F5H0A9 414 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 J3KRW8 73 aa0.22□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADAM20O43506 726 aa0.22□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CSO75390 466 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TADA2AO75478 443 aa0.22□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MMP23AO75900 390 aa0.22□□□□□ -2.37
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms