RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 LIMK2P53671 638 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 CRYBA2P53672 197 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 FAM189A2Q15884 450 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 RAET1GQ6H3X3 334 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF730Q6ZMV8 503 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC17Q8N6Y2 441 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 GVQW1Q8N7I0 195 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 NMUR1Q9HB89 426 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 CACNG5Q9UF02 275 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087X002 238 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0U1RRA0 63 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 GNSP15586 552 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 RPA1P27694 616 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 PDHA2P29803 388 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 FCGR2CP31995 323 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 NME3Q13232 169 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 RIGQ13278 110 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 IL23RQ5VWK5 629 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 IRGCQ6NXR0 463 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZRG5 221 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 PARP8Q8N3A8 854 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 RNF148Q8N7C7 305 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC110Q8TBZ0 833 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 NGBQ9NPG2 151 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM181Q9P2C4 612 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 A8MU76 341 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 SOCS5O75159 536 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ZFAND5O76080 213 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 CALCAP01258 141 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 PROS1P07225 676 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 CFC1BP0CG36 223 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 CFC1P0CG37 223 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 AOC1P19801 751 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJB1P25685 340 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 AKT2P31751 481 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 HSPA1LP34931 641 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 NDST2P52849 883 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 SLC26A5P58743 744 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 DPYSQ14117 519 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM187Q14656 261 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 BNIPLQ7Z465 357 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 SYVN1Q86TM6 617 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF614Q8N883 585 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 POLE3Q9NRF9 147 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 BARHL2Q9NY43 387 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 OR5H15A6NDH6 313 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 MPTX1A8MV57 137 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 KPNA7A9QM74 516 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 CSO75390 466 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ANXA9O76027 345 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 PPP2R1AP30153 589 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 CHRNA3P32297 505 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 SNX1Q13596 522 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TEX35Q5T0J7 233 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ASRGL1Q7L266 308 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRC-212ENST00000491302 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.5□□□□□ -1.37
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