RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813		A8MXE2	369 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	AP3B1	O00203	1094 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	SLC16A5	O15375	505 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	OR6B1	O95007	311 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	RCBTB2	O95199	551 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	SLC16A8	O95907	504 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	ESR1	P03372	595 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	FES	P07332	822 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	CYP4B1	P13584	511 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	PPP3CB	P16298	524 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	HNF1A	P20823	631 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	SERPINB3	P29508	390 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	AHR	P35869	848 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	DNASE1L1	P49184	302 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	GPR143	P51810	404 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	HK2	P52789	917 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	NR1H2	P55055	460 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	DUSP8	Q13202	625 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	BIK	Q13323	160 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	BMPR2	Q13873	1038 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	SQLE	Q14534	574 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	GBX1	Q14549	363 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	STX1A	Q16623	288 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	MPEG1	Q2M385	716 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	BEX5	Q5H9J7	111 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	VASN	Q6EMK4	673 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	CASC4	Q6P4E1	433 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	PDSS2	Q86YH6	399 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	PLD3	Q8IV08	490 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	KRT222	Q8N1A0	295 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	AMER2	Q8N7J2	671 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF611	Q8N823	705 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	KCT2	Q8NC54	265 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	ZNF480	Q8WV37	535 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	ANKRD7	Q92527	254 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	NCLN	Q969V3	563 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	REPS1	Q96D71	796 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	TRIB1	Q96RU8	372 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	PKP4	Q99569	1192 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	TIMP4	Q99727	224 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	HAUS8	Q9BT25	410 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	P2RY12	Q9H244	342 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	TG	P01266	2768 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	DYSF	O75923	2080 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	NOTCH1	P46531	2555 aa		5.15	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	MED12L	Q86YW9	2145 aa		5.15	□□□□□ -1.58
CEP170-216	ENST00000490813	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	OR51F1	A6NGY5	319 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813		A8MUA0	341 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813		E5RI56	91 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	WWP2	O00308	870 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	TP53I11	O14683	189 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	NDUFS4	O43181	175 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	CEP104	O60308	925 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	SNX4	O95219	450 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	ACTL6A	O96019	429 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	C1QA	P02745	245 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	CELA3A	P09093	270 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	MPC1L	P0DKB6	136 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	TNNT1	P13805	278 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	COX7A2	P14406	83 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	MAOA	P21397	527 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	GDF1	P27539	372 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	CD79B	P40259	229 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
CEP170-216	ENST00000490813	CCR8	P51685	355 aa		5.15	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms