RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67	2e-7	■■■■□ 21
KRIT1-222	ENST00000486261	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TPD52L3	Q96J77	140 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NDN	Q99608	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CLMP	Q9H6B4	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	C5AR2	Q9P296	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	C3orf18	Q9UK00	162 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NUMA1	Q14980	2115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC22A2	O15244	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CH25H	O95992	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	PNP	P00491	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	KRT8	P05787	483 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CEACAM5	P06731	702 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NUDT7	P0C024	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CR2	P20023	1033 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	HNF1A	P20823	631 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	PKLR	P30613	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	PHB	P35232	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	PTPN7	P35236	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC15A1	P46059	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CYP4F2	P78329	520 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	MMRN1	Q13201	1228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	RGMA	Q96B86	450 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261		K7ENP7	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	MAP2K7	O14733	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	AVIL	O75366	819 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	OR2B3	O76000	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	STK17B	O94768	372 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	S1PR4	O95977	384 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SOX18	P35713	384 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ACTR3	P61158	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	RIN1	Q13671	783 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	PAOX	Q6QHF9	649 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	LYPD8	Q6UX82	237 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	POC5	Q8NA72	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	BTBD6	Q96KE9	485 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	CGREF1	Q99674	301 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KRIT1-222	ENST00000486261	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67

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