RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TUBAL3A6NHL2 446 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 AQP7O14520 342 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP6AP2O75787 350 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 HRGP04196 525 aa8.69□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 EPXP11678 715 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 BMP5P22003 454 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PEX19P40855 299 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 DNASE1L1P49184 302 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MTTPP55157 894 aa8.69□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 FRA10AC1Q70Z53 315 aa8.69□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 OR8K3Q8NH51 312 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.69□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 NT5DC2Q9H857 520 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 TEX264Q9Y6I9 313 aa8.69□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 C17orf105B2RV13 164 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TAPBPO15533 448 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ETHE1O95571 254 aa8.68□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 HPDP32754 393 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.68□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC35F6Q8N357 371 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SPATA6LQ8N4H0 392 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SNX31Q8N9S9 440 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 NAXEQ8NCW5 288 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5L2Q8NGL0 311 aa8.68□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 KIAA1191Q96A73 305 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRC39Q96DD0 335 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CAPZA3Q96KX2 299 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM79Q9BSE2 394 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 YIPF4Q9BSR8 244 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 EHD1Q9H4M9 534 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 LYRM4Q9HD34 91 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PRDM7Q9NQW5 492 aa8.68□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 DNAJC11Q9NVH1 559 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ALKBH4Q9NXW9 302 aa8.68□□□□□ -1.02
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SMARCE1-210ENST00000481231 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 B4GALT7Q9UBV7 327 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 ATG4BQ9Y4P1 393 aa8.68□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 RTCAO00442 366 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 SUSD5O60279 629 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 WDR1O75083 606 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 LDB3O75112 727 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 PIAS1O75925 651 aa8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SMARCE1-210ENST00000481231 P04436 131 aa8.67□□□□□ -1.02
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