RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480452.5

DSCR3-208, Transcript of Down syndrome critical region protein 3, human

TSL 2

Gene DSCR3, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DSCR3-208	ENST00000480452	GRK2	P25098	689 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	GIF	P27352	417 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	AKT1	P31749	480 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	FUT7	Q11130	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	RAB35	Q15286	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	TEX29	Q8N6K0	151 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	KCT2	Q8NC54	265 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	VMP1	Q96GC9	406 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	OXSM	Q9NWU1	459 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	C5orf63	A6NC05	138 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	P2RX6	O15547	441 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	VPS26A	O75436	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	GPC4	O75487	556 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452		P04436	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	CD3E	P07766	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	NUDT17	P0C025	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	CCNC	P24863	283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	SERPINB6	P35237	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	TRPC1	P48995	793 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	PDLIM4	P50479	330 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	KCNJ2	P63252	427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	ID3	Q02535	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	PKP1	Q13835	747 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	DPYSL2	Q16555	572 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	NDUFA9	Q16795	377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	OR2A2	Q6IF42	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	CMIP	Q8IY22	773 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452		Q8N3U1	123 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	OR8K3	Q8NH51	312 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	UBE2F	Q969M7	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DSCR3-208	ENST00000480452	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms