RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ACPTQ9BZG2 426 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TRAV17A0A0B4J275 112 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 SERTM1A2A2V5 107 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CCDC151A5D8V7 595 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 GLOD5A6NK44 160 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 C17orf105B2RV13 164 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TYROBPO43914 113 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 GPR75O95800 540 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TNNI3P19429 210 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ALDH3A1P30838 453 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 STT3AP46977 705 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ST13P50502 369 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 MLF1P58340 268 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 BIKQ13323 160 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 MORN4Q8NDC4 146 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 OR14A16Q8NHC5 309 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ZIM3Q96PE6 472 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.722e-23■■■□□ 15.6
ACTB-211ENST00000480301 SENP1Q9P0U3 644 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 NTNG1Q9Y2I2 539 aa19.53■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 GABRR3A8MPY1 467 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 H3BQF6 201 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 PGRMC2O15173 223 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 DDAH2O95865 285 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 SERPINB3P29508 390 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CD96P40200 585 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 HMGCS1Q01581 520 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TUBA3CQ13748 450 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 CEP85LQ5SZL2 805 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TUBA3EQ6PEY2 450 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 SCIMPQ6UWF3 145 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ZNF321PQ8N8H1 164 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 TM4SF18Q96CE8 201 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 MECRQ9BV79 373 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 WDR41Q9HAD4 459 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ASF1BQ9NVP2 202 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 ABI3Q9P2A4 366 aa19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
ACTB-211ENST00000480301 BAHCC1Q9P281 2608 aa19.52■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ARHGAP10A1A4S6 786 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 MAPK12P53778 367 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 KCNC4Q03721 635 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A12Q8TD20 617 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB9Q96C00 473 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 APIPQ96GX9 242 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 DGAT2Q96PD7 388 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD10Q9NXR5 420 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 SHANK1Q9Y566 2161 aa19.51■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 TMEM200CA6NKL6 621 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ETV4P43268 484 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 RAE1P78406 368 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ASPHQ12797 758 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 OR52E8Q6IFG1 317 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 LRIG3Q6UXM1 1119 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 EXOC3L1Q86VI1 746 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 GALNT11Q8NCW6 608 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 MDS2Q8NDY4 140 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ZNF721Q8TF20 911 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 TRMOQ9BU70 441 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 OR8D2Q9GZM6 311 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 MCM8Q9UJA3 840 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 CES1P1Q9UKY3 287 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa19.5■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PS29 197 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 CDK2AP1O14519 115 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 CTIFO43310 598 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF2O60811 474 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 GUCY1B2O75343 617 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ERLIN1O75477 346 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 ZFAND5O76080 213 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 UROSP10746 265 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 COX7A2P14406 83 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
ACTB-211ENST00000480301 PLIN5Q00G26 463 aa19.49■□□□□ 0.71
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