RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466624.1

GPC1-207, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 782 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-207ENST00000466624 MRGPREQ86SM8 312 aa15.01□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 LIX1Q8N485 282 aa15.01□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 TSLPQ969D9 159 aa15.01□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 EGLN2Q96KS0 407 aa15.01□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 OR52B2Q96RD2 323 aa15.01□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 NPHS2Q9NP85 383 aa15.01□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 TCF7L2Q9NQB0 619 aa15.01□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 TAS2R7Q9NYW3 318 aa15.01□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 HEY2Q9UBP5 337 aa15.01□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa15.01□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 PCSK5Q92824 1860 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 CDC14CA4D256 554 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 OR2W5A6NFC9 320 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 TGFBR3LH3BV60 316 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 PGRMC2O15173 223 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 NKX2-8O15522 239 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 LDB3O75112 727 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 G6PDP11413 515 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 DDX5P17844 614 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 PIK3R1P27986 724 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 GYS2P54840 703 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 FOLH1Q04609 750 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 VAC14Q08AM6 782 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 PDE7AQ13946 482 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 TERF2Q15554 542 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 NXNQ6DKJ4 435 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 CGB2Q6NT52 195 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 KIRREL2Q6UWL6 708 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 OR11G2Q8NGC1 345 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 OR4K14Q8NGD5 310 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 CATSPER2Q96P56 530 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 TSSK3Q96PN8 268 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 EBF4Q9BQW3 602 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 BRINP2Q9C0B6 783 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 REEP4Q9H6H4 257 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 KCNK13Q9HB14 408 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 MIEF1Q9NQG6 463 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 AIG1Q9NVV5 245 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 POLHQ9Y253 713 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa15□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 GLOD5A6NK44 160 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 PEX12O00623 359 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 FURINP09958 794 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 COX6A1P12074 109 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 IDO1P14902 403 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 PRPS1L1P21108 318 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 GALNSP34059 522 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 ALDH9A1P49189 494 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 DIO3P55073 304 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 CLDN8P56748 225 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 GNGT1P63211 74 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 PTGR1Q14914 329 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 PCOLCEQ15113 449 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 CEBPEQ15744 281 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 GSTA3Q16772 222 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 CPZQ66K79 652 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 LANCL3Q6ZV70 420 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 MMP21Q8N119 569 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 RFWD2Q8NHY2 731 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 UCN3Q969E3 161 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 ADAP2Q9NPF8 381 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 UTS2RQ9UKP6 389 aa14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 A0A0G2JND7 137 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 UBDO15205 165 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 HPP00738 406 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 SLC35E2P0CK97 266 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 HPCAL1P37235 193 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 STT3AP46977 705 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 RRADP55042 308 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 OR4D2P58180 307 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 PLIN5Q00G26 463 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 ATP1A4Q13733 1029 aa14.98□□□□□ -0.01
GPC1-207ENST00000466624 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms