RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464322.5

CENPF-202, Transcript of centromere protein F, humanhuman

TSL 2

Gene CENPF, Length 689 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-202ENST00000464322 DOHHQ9BU89 302 aa13.11□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 BDH2Q9BUT1 245 aa13.11□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 ACKR4Q9NPB9 350 aa13.11□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 DAPP1Q9UN19 280 aa13.11□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 CYR61O00622 381 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 DYRK3O43781 588 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 LRATO95237 230 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 HRGP04196 525 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 CTSSP25774 331 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 HPDP32754 393 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 OPRM1P35372 400 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 MSH2P43246 934 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 CPA2P48052 419 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 PGGT1BP53609 377 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 TGM3Q08188 693 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 MCUQ8NE86 351 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 OR2L5Q8NG80 312 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 ZNF592Q92610 1267 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 COX4I2Q96KJ9 171 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 Q96MF0 132 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 QPCTLQ9NXS2 382 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 SPACA6W5XKT8 324 aa13.1□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 VPS13CQ709C8 3753 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 INAFM1C9JVW0 142 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 WDR47O94967 919 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 GOSR1O95249 250 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 ETHE1O95571 254 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 ACSL3O95573 720 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 GNAZP19086 355 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 SERPINB3P29508 390 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 MAGEA6P43360 314 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 RPL21P46778 160 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 ZNF75DP51815 510 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 SORDQ00796 357 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 PM20D2Q8IYS1 436 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 RASGEF1CQ8N431 466 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 SIMC1Q8NDZ2 872 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 PAQR8Q8TEZ7 354 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 ZNF721Q8TF20 911 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 QRFPRQ96P65 431 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 GAL3ST4Q96RP7 486 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 TIMP4Q99727 224 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 CNIH4Q9P003 139 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 VWA7Q9Y334 891 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 FREM3P0C091 2139 aa13.09□□□□□ -0.31
CENPF-202ENST00000464322 LRRC3CA6NJW4 275 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CLGNO14967 610 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 ERN1O75460 977 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CLEC3AO75596 197 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 AHSGP02765 367 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 GABRB3P28472 473 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 GDF5P43026 501 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 MASP1P48740 699 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 ABHD17CQ6PCB6 329 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 OR4N5Q8IXE1 308 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 OR10G3Q8NGC4 313 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 NUBPLQ8TB37 319 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 DIO2Q92813 273 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 PIGTQ969N2 578 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SIGLEC10Q96LC7 697 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 ZNF597Q96LX8 424 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 DACH2Q96NX9 599 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 DGAT2Q96PD7 388 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SLC6A5Q9Y345 797 aa13.08□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SH3D21A4FU49 640 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CCDC175P0C221 793 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 PGAM1P18669 254 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 RCAN2Q14206 197 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CRYMQ14894 314 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 POMZP3Q6PJE2 187 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SBSNQ6UWP8 590 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 CAPN12Q6ZSI9 719 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 FRA10AC1Q70Z53 315 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 LUZP2Q86TE4 346 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 SLC15A4Q8N697 577 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 DOK4Q8TEW6 326 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 ISL2Q96A47 359 aa13.07□□□□□ -0.32
CENPF-202ENST00000464322 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms