RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 EPYCQ99645 322 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DOK1Q99704 481 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GABARAPL3Q9BY60 117 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 RAD21L1Q9H4I0 556 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NEUROD4Q9HD90 331 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 KCMF1Q9P0J7 381 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SH3BP4Q9P0V3 963 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ANKMY1Q9P2S6 941 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 DMTF1Q9Y222 760 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GPSM3Q9Y4H4 160 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ATG4BQ9Y4P1 393 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CACNA1EQ15878 2313 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DSPPQ9NZW4 1301 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 A0A087WXM4 84 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PS29 197 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ARRDC5A6NEK1 342 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 WASHC1A8K0Z3 465 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PDZK1P1A8MUH7 402 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 hCG_2039718K7EN88 272 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 HMGN4O00479 90 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FFAR1O14842 300 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PGRMC2O15173 223 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 P2RX6O15547 441 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SUV39H1O43463 412 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PROM1O43490 865 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEF10O60809 474 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 MITFO75030 526 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJB5O75953 348 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 MFN2O95140 757 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 KRT75O95678 551 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF682O95780 498 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 AIFM1O95831 613 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 EPPINO95925 133 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 C9P02748 559 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ALBP02768 609 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NTRK1P04629 796 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 JUNDP17535 347 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 CBLP22681 906 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CMPK1P30085 196 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 AKT2P31751 481 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NUDT1P36639 197 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 DGKEP52429 567 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GABARAPL2P60520 117 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DSTNP60981 165 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 CD47Q08722 323 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 LSAMPQ13449 338 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 KEAP1Q14145 624 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GPR18Q14330 331 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC32Q14392 662 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-210ENST00000462363 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TTC23Q5W5X9 447 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 XAF1Q6GPH4 301 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SLC48A1Q6P1K1 146 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM40Q6P9F5 258 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF773Q6PK81 442 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ENPP7Q6UWV6 458 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZSR6 202 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 RNF44Q7L0R7 432 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 COMTD1Q86VU5 262 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ARMC8Q8IUR7 673 aa5.34□□□□□ -1.55
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