RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 ESAMQ96AP7 390 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 TSPAN17Q96FV3 270 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 DGAT2Q96PD7 388 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CNPPD1Q9BV87 410 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 ALKBH4Q9NXW9 302 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 SPRR3Q9UBC9 169 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa24.32■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 DYRK3O43781 588 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CCDC166P0CW27 439 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CPN2P22792 545 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 MSH2P43246 934 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 ATP6V0D1P61421 351 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 DR1Q01658 176 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 ID2Q02363 134 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 IRF8Q02556 426 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 BIKQ13323 160 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 E2F2Q14209 437 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 ADGRD1Q6QNK2 874 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 C9orf40Q8IXQ3 194 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 SPATA6LQ8N4H0 392 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 UBE2E3Q969T4 207 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 ART5Q96L15 291 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 ZFP64Q9NPA5 681 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF358Q9NW07 568 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 QPCTLQ9NXS2 382 aa24.31■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 E7ESA3 106 aa24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 IGKV3-11P04433 115 aa24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CD1DP15813 335 aa24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 TCP1P17987 556 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CASP2P42575 452 aa24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 KIR2DL3P43628 341 aa24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 KCNJ2P63252 427 aa24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CHIT1Q13231 466 aa24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 AP5B1Q2VPB7 878 aa24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 FBXW8Q8N3Y1 598 aa24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 PHACTR1Q9C0D0 580 aa24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CAB39LQ9H9S4 337 aa24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 ACKR4Q9NPB9 350 aa24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 EDARQ9UNE0 448 aa24.3■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 HSPB2A8KAH6 182 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 RTCAO00442 366 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 FGF17O60258 216 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 EPORP19235 508 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 SERPINB1P30740 379 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 SSR2P43308 183 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 PPP2R2AP63151 447 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 OR4D1Q15615 310 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 HSPB2Q16082 182 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 LYPD8Q6UX82 237 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CHSY3Q70JA7 882 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 KLHL7Q8IXQ5 586 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 BBOF1Q8ND07 529 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 KRT12Q99456 494 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 PRM3Q9NNZ6 103 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 RASSF1Q9NS23 344 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 MS4A12Q9NXJ0 267 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CD274Q9NZQ7 290 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CNIH4Q9P003 139 aa24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 SYT5O00445 386 aa24.28■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 TP73O15350 636 aa24.28■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 S100BP04271 92 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 RFPL3SP0C7P2 107 aa24.28■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 PLIN5Q00G26 463 aa24.28■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CBLBQ13191 982 aa24.28■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 LAS2Q8IYD9 372 aa24.28■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 ULK2Q8IYT8 1036 aa24.28■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 FBXL20Q96IG2 436 aa24.28■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 SMYD2Q9NRG4 433 aa24.28■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 KLK2P20151 261 aa24.27■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 PRAMEF20Q5VT98 475 aa24.27■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 MED27Q6P2C8 311 aa24.27■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 OR4N5Q8IXE1 308 aa24.27■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 ZBED8Q8IZ13 594 aa24.27■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 NEIL3Q8TAT5 605 aa24.27■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 TANKQ92844 425 aa24.27■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC46Q96FV0 321 aa24.27■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CMTM7Q96FZ5 175 aa24.27■■□□□ 1.48
PBRM1-218ENST00000458294 CD244Q9BZW8 370 aa24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms