RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454716.1

RPS3AP53-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 53, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP53, Length 778 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP53-201ENST00000454716 PNCKQ6P2M8 343 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF449Q6P9G9 518 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 GBP6Q6ZN66 633 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 SMIM29Q86T20 159 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMEM135Q86UB9 458 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 TEX19Q8NA77 164 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMEM35BQ8NCS4 154 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 CCDC112Q8NEF3 446 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 CEP70Q8NHQ1 597 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 HCAR2Q8TDS4 363 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 SSC4DQ8WTU2 575 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 TANKQ92844 425 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 TBC1D31Q96DN5 1066 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 FBXO17Q96EF6 278 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 NSMCE3Q96MG7 304 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 GSDMCQ9BYG8 508 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 PDCL3Q9H2J4 239 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 POU2F3Q9UKI9 436 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 CDC14AQ9UNH5 594 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.97□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 FBN2P35556 2912 aa4.96□□□□□ -1.61
RPS3AP53-201ENST00000454716 A0A0G2JPF8 293 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 A0A1W2PS18 150 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 BICDL2A1A5D9 508 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 PEX12O00623 359 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 XPNPEP2O43895 674 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 STK17BO94768 372 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 CLDN1O95832 211 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 EML2O95834 649 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 SLC2A4P14672 509 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 CYP11B1P15538 503 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 DCTP40126 519 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 GLIPR1P48060 266 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZBTB17Q13105 803 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 EXOC3L4Q17RC7 722 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 ESCO2Q56NI9 601 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 CFAP58Q5T655 872 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 NAA35Q5VZE5 725 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 BRAT1Q6PJG6 821 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 CEACAM20Q6UY09 585 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 ASB18Q6ZVZ8 466 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 DPPA4Q7L190 304 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 HEATR4Q86WZ0 1026 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 CREBRFQ8IUR6 639 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 CCDC13Q8IYE1 715 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM71AQ8IYT1 594 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 PARP16Q8N5Y8 322 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 GJC3Q8NFK1 279 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 JOSD2Q8TAC2 188 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 RXFP2Q8WXD0 754 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 ECHDC3Q96DC8 303 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMEM19Q96HH6 336 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 FAM81BQ96LP2 452 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 PDFQ9HBH1 243 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 PDP2Q9P2J9 529 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 DNAJC12Q9UKB3 198 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 CARD8Q9Y2G2 431 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa4.96□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 CACNA1DQ01668 2161 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 DNHD1Q96M86 4753 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 A0A0U1RQS6 177 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 MKRN2OSH3BPM6 223 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 P2RY10O00398 339 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 ZW10O43264 779 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 CREB3O43889 395 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 PRAMEF11O60813 436 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 TNFAIP3P21580 790 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 SDC4P31431 198 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 DLSTP36957 453 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 PIGAP37287 484 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 PPP1R2P41236 205 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 ACTR1BP42025 376 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 ACTR1AP61163 376 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 CDK3Q00526 305 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 MC1RQ01726 317 aa4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RPS3AP53-201ENST00000454716 PARP15Q460N3 678 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms