RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439009.1

LINC00578-201, long intergenic non-protein coding RNA 578, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene LINC00578, Length 542 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00578-201ENST00000439009 GPS1Q13098 491 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SLC13A2Q13183 592 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 BMPR2Q13873 1038 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 KEAP1Q14145 624 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SLC22A10Q63ZE4 541 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SBSNQ6UWP8 590 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 LYPD8Q6UX82 237 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CHSY3Q70JA7 882 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CROCCP2Q86T23 111 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 KIF18BQ86Y91 864 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SLC15A4Q8N697 577 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF321PQ8N8H1 164 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TNIP2Q8NFZ5 429 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TTLQ8NG68 377 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 NUBPLQ8TB37 319 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 IFT81Q8WYA0 676 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 KIAA1191Q96A73 305 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 LINGO1Q96FE5 620 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 FAR2Q96K12 515 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TSNARE1Q96NA8 513 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SERPINB12Q96P63 405 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 NDNQ99608 321 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 LDAHQ9H6V9 325 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PROK2Q9HC23 129 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ALKBH4Q9NXW9 302 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 JKAMPQ9P055 326 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SLC22A14Q9Y267 594 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 IKBKGQ9Y6K9 419 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 HIVEP2P31629 2446 aa7.27□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 A0A088AWK7 358 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 LRRC3CA6NJW4 275 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 H3BQF6 201 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ERI3O43414 337 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 B3GALT2O43825 422 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CLEC3AO75596 197 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 LY6G6DO95868 133 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 IL18BPO95998 194 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 HRGP04196 525 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 IGKV3-11P04433 115 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 BMP5P22003 454 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TACR1P25103 407 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 HPDP32754 393 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PIGAP37287 484 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF136P52737 540 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 LIM2P55344 173 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 DCAF7P61962 342 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CDKL1Q00532 357 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SERTAD2Q14140 314 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 RCN2Q14257 317 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 LRIG3Q6UXM1 1119 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 TAOK1Q7L7X3 1001 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 LACC1Q8IV20 430 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 FAM47BQ8NA70 645 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 OR2L5Q8NG80 312 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SLC2A12Q8TD20 617 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ZNF721Q8TF20 911 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 DACH2Q96NX9 599 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 SERINC2Q96SA4 455 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PIP5K1AQ99755 562 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 LYRM4Q9HD34 91 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 CNIH4Q9P003 139 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00578-201ENST00000439009 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms