RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTNSO60931 367 aa15.94■□□□□ 0.14
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 STK17BO94768 372 aa15.94■□□□□ 0.14
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IGF2-ASQ6U949 168 aa15.92■□□□□ 0.14
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SHISA5Q8N114 240 aa15.92■□□□□ 0.14
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TOP3BP1-201ENST00000420768 AMDHD1Q96NU7 426 aa15.92■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTBD10Q9BSF8 475 aa15.92■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPRY4Q9C004 299 aa15.92■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR54Q9H977 334 aa15.92■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAS2R9Q9NYW1 312 aa15.92■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTSFQ9UBX1 484 aa15.92■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCDC2BA2VCK2 349 aa15.91■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 VSTM2BA6NLU5 285 aa15.91■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 C9J4A7 227 aa15.91■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 LDB3O75112 727 aa15.91■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLITRK5O94991 958 aa15.91■□□□□ 0.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANP32DO95626 131 aa15.91■□□□□ 0.14
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZGLP1P0C6A0 271 aa15.91■□□□□ 0.14
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