RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VGLL3A8MV65 326 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCSO14618 274 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SIGLEC5O15389 551 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TNFSF14O43557 240 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BAG3O95817 575 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGKV1-39P01597 117 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGLV2-8P01709 118 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGKV1D-39P04432 117 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MYL3P08590 195 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SBK2P0C263 348 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR9G9P0C7N8 305 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SAGP10523 405 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VPREB1P12018 145 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DNASE1P24855 282 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CTNNA2P26232 953 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TGFBR1P36897 503 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ERFP50548 548 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPS8P62241 208 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 VAMP2P63027 116 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRAMEP78395 509 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KLHL30Q0D2K2 578 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ODR4Q5SWX8 454 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM120AOSQ5T036 256 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMCO3Q6UWJ1 677 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C6orf120Q7Z4R8 191 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF683Q8IZ20 524 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ELMOD1Q8N336 334 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TEX26Q8N6G2 289 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FRMD1Q8N878 549 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PGM2Q96G03 612 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR10C1Q96KK4 312 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SFXN2Q96NB2 322 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KLHL5Q96PQ7 755 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PLEKHF1Q96S99 279 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TM2D3Q9BRN9 247 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRRG4Q9BZD6 226 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GPR61Q9BZJ8 451 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UBA5Q9GZZ9 404 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPATC1LQ9H0A9 340 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PTGES2Q9H7Z7 377 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 Q9H8V8 135 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RNF121Q9H920 327 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM106BQ9NUM4 274 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC2A8Q9NY64 477 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 STRCP1A6NGW2 1772 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LTBP2Q14767 1821 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRAV24A0A0B4J272 114 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM149AA5PLN7 773 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CASTOR2A6NHX0 329 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMCO5BA8MYB1 307 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LMO7DNF2Z398 122 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 G3V3Y1 287 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SNAP23O00161 211 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC17A2O00624 439 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR6A2O95222 327 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NUDT14O95848 222 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GOT2P00505 430 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 INSP01308 110 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGLV6-57P01721 117 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FOSL2P15408 326 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GJA1P17302 382 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HOXA9P31269 272 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UGT1A5P35504 534 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ARHGDIBP52566 201 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PEX3P56589 373 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NOP14P78316 857 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MADCAM1Q13477 382 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PICALMQ13492 652 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DPYSQ14117 519 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC10A1Q14973 349 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CD226Q15762 336 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR2B11Q5JQS5 317 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRR27Q6MZM9 219 aa-0.4□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms