RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 LDB3O75112 727 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 JRKO75564 520 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 SCRG1O75711 98 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 NQO1P15559 274 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ITIH1P19827 911 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 FRKP42685 505 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 SLC7A2P52569 658 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ARSFP54793 590 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ID2Q02363 134 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 PPP1R3BQ86XI6 285 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 VPS37AQ8NEZ2 397 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ZNF681Q96N22 645 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 PDE5AO76074 875 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ZNF621Q6ZSS3 439 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 SLC15A3Q8IY34 581 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 OR4A15Q8NGL6 344 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 MCUR1Q96AQ8 359 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CMTM6Q9NX76 183 aa21.92■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 KNTC1P50748 2209 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 A0A1B0GX78 115 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 H0YHG0 523 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 FGF17O60258 216 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 MT-CO3P00414 261 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 NPPAP01160 153 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 FGF5P12034 268 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 RNH1P13489 461 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 LIMK1P53667 647 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 MTPNP58546 118 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 SKP1P63208 163 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 MC2RQ01718 297 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 GAB1Q13480 694 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 RHBDD2Q6NTF9 364 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CCDC116Q8IYX3 515 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 SUN3Q8TAQ9 357 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 MVB12AQ96EY5 273 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 AMDHD1Q96NU7 426 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 GLIPR2Q9H4G4 154 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 NDE1Q9NXR1 346 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ADA2Q9NZK5 511 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 TMEM181Q9P2C4 612 aa21.91■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 NME4O00746 187 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 TM4SF5O14894 197 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CSO75390 466 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ERN1O75460 977 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ZNF28P17035 718 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 XCR1P46094 333 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 TRPC1P48995 793 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 MANFP55145 182 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 FOLH1Q04609 750 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CEACAM7Q14002 265 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 IL11RAQ14626 422 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 OR52E8Q6IFG1 317 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 NIPAL1Q6NVV3 410 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ULK2Q8IYT8 1036 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 TMEM125Q96AQ2 219 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ANKRD27Q96NW4 1050 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 CMKLR1Q99788 373 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 SPAG4Q9NPE6 437 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 SLC22A11Q9NSA0 550 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 SPACA6W5XKT8 324 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 MYO1GB0I1T2 1018 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 B4GALT2O60909 372 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ETV5P41161 510 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 HSPB3Q12988 150 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 HES3Q5TGS1 186 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 HPS6Q86YV9 775 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 COL26A1Q96A83 441 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 GBP5Q96PP8 586 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 BBS4Q96RK4 519 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ZNF304Q9HCX3 659 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 FBXO8Q9NRD0 319 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 LOXL2Q9Y4K0 774 aa21.9■■□□□ 1.1
CNN3-202ENST00000394202 ANP32DO95626 131 aa21.89■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 XKP51811 444 aa21.89■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 RUNDC3AQ59EK9 446 aa21.89■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PGM2L1Q6PCE3 622 aa21.89■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 C10orf111Q8N326 155 aa21.89■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 FAM156AQ8NDB6 213 aa21.89■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 YIPF2Q9BWQ6 316 aa21.89■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 CXorf36Q9H7Y0 433 aa21.89■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 TAS2R9Q9NYW1 312 aa21.89■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 TRPC4Q9UBN4 977 aa21.89■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 SRPK3Q9UPE1 567 aa21.89■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 PRORSD1PA6NEY8 169 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 TGFBR3LH3BV60 316 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 DKK1O94907 266 aa21.88■■□□□ 1.09
CNN3-202ENST00000394202 FTH1P19P0C7X4 201 aa21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms