RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384105.1

RNU6V-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear variant sequence with SNRPE pseudogene sequence, humanhuman

BASIC

Gene RNU6V, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6V-201ENST00000384105 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SARM1Q6SZW1 724 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ARSKQ6UWY0 536 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CD300LGQ6UXG3 332 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 QSOX2Q6ZRP7 698 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 Q6ZSA8 131 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 BRINP3Q76B58 766 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DPPA4Q7L190 304 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 OTOAQ7RTW8 1153 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GLRX5Q86SX6 157 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LINC00596Q86U02 117 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GPBP1Q86WP2 473 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LYPD6Q86Y78 171 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GPHB5Q86YW7 130 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NAXDQ8IW45 347 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LAX1Q8IWV1 398 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CNTN4Q8IWV2 1026 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LINC01561Q8N1V8 128 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 C6orf223Q8N319 242 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MT1MQ8N339 61 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF786Q8N393 782 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 C17orf78Q8N4C9 275 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 BPIFB2Q8N4F0 458 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ARL14Q8N4G2 192 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZDHHC22Q8N966 263 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 AVL9Q8NBF6 648 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SLC38A9Q8NBW4 561 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 OR4S1Q8NGB4 309 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 OR4D11Q8NGI4 311 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 OR52K2Q8NGK3 314 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 OR1J2Q8NGS2 313 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 OR4Q3Q8NH05 313 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 OR1L3Q8NH93 324 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 C8orf46Q8TAG6 207 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 FAM71BQ8TC56 605 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 KIAA1524Q8TCG1 905 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SPPL2AQ8TCT8 520 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SPACA4Q8TDM5 124 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 AFG1LQ8WV93 481 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GTSF1Q8WW33 167 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DNAJB3Q8WWF6 145 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RLN3Q8WXF3 142 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 FAM3CQ92520 227 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GOLGA1Q92805 767 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PTERQ96BW5 349 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 EID2BQ96D98 161 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZBTB10Q96DT7 871 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 FAHD2AQ96GK7 314 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MSANTD3Q96H12 275 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 SLC35E1Q96K37 410 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 BMFQ96LC9 184 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 GSDMAQ96QA5 445 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ACOX2Q99424 681 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CITED1Q99966 193 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NABP2Q9BQ15 211 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 KLHDC3Q9BQ90 382 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CCDC28BQ9BUN5 200 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ACAT2Q9BWD1 397 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NFKBIZQ9BYH8 718 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LMAN2LQ9H0V9 348 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 CDH19Q9H159 772 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 NEUROG2Q9H2A3 272 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 VCXQ9H320 206 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PPDPFQ9H3Y8 114 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 POMKQ9H5K3 350 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RABEP2Q9H5N1 569 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 MAGIXQ9H6Y5 334 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 DNAJC18Q9H819 358 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 TUBA4BQ9H853 241 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 LY9Q9HBG7 655 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 APMAPQ9HDC9 416 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6V-201ENST00000384105 RIC8AQ9NPQ8 531 aa-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms