RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SLCO1A2P46721 670 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 CYB561P49447 251 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 HLCSP50747 726 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 CCNG1P51959 295 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 MLF1P58340 268 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 RPS13P62277 151 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 STX4Q12846 297 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 SPINK14Q6IE38 97 aa7.14□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.14□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.14□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 SEC14L3Q9UDX4 400 aa7.14□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 HERVK_113P63132 956 aa7.13□□□□□ -1.27
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SGMS1-201ENST00000361543 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SGMS1-201ENST00000361543 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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