RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 CATSPEREQ5SY80 951 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 C15orf40Q8WUR7 153 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF285Q96NJ3 590 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 ATG5Q9H1Y0 275 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 NUP50Q9UKX7 468 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 UNCXA6NJT0 531 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 EMC8O43402 210 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 OTX2P32243 289 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 E2F1Q01094 437 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 NIPAL1Q6NVV3 410 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 GRPEL2Q8TAA5 225 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf21Q9H246 121 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 NPPAP01160 153 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 ADORA3P0DMS8 318 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 LRIF1Q5T3J3 769 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 PEX11GQ96HA9 241 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 FLRT2O43155 660 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 PEPDP12955 493 aa21.45■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF100Q8IYN0 542 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC42Q9Y546 428 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 NFAT5O94916 1531 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 SLC16A5O15375 505 aa21.45■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 FAM189A2Q15884 450 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 OR4C11Q6IEV9 310 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 SEC14L1Q92503 715 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 KCNK12Q9HB15 430 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 MEN1O00255 615 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 CST6Q15828 149 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 LPAL2Q16609 132 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 LIPKQ5VXJ0 399 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 LAS2Q8IYD9 372 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 A0A096LPI6 279 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 EPOP01588 193 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 OR52P1PQ8NH57 321 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 SLC30A2Q9BRI3 323 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 MVB12BQ9H7P6 319 aa21.44■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 RFPL1O75677 317 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 GID4Q8IVV7 300 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 OR8K5Q8NH50 307 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 DHDHQ9UQ10 334 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 S1PR4O95977 384 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 C3orf33Q6P1S2 294 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa21.43■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 TSPAN33Q86UF1 283 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 SLC6A7Q99884 636 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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PTPRM-201ENST00000332175 AK4P27144 223 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 RUNX3Q13761 415 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 CES4AQ5XG92 561 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 ARSKQ6UWY0 536 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 FCAMRQ8WWV6 532 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R14BQ96C90 147 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 PIP5K1AQ99755 562 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 STRA6Q9BX79 667 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 A8MV72 311 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 GMPRP36959 345 aa21.43■■□□□ 1.02
PTPRM-201ENST00000332175 NXPE4Q6UWF7 544 aa21.43■■□□□ 1.02
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