RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 SPARTQ8N0X7 666 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 NAXEQ8NCW5 288 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 KLK6Q92876 244 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 C17orf62Q9BQA9 187 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 ADAMTSL3P82987 1691 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 ITGA5P08648 1049 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 OR12D1P0DN82 309 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF20P17024 532 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 AGXTP21549 392 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 HTR2AP28223 471 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 FXYD6P3P58550 94 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 GRIK2Q13002 908 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 LIPJQ5W064 366 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 OR8K3Q8NH51 312 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 TFAP2CQ92754 450 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 C7orf34Q96L11 122 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 FNIP2Q9P278 1114 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 ELNP15502 786 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 SOX3P41225 446 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 GINS1Q14691 196 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 FANK1Q8TC84 345 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 ZFP90Q8TF47 636 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 KDELR3O43731 214 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 RHCEP18577 417 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 IL4RP24394 825 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 DCKP27707 260 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 GKP32189 559 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 BDKRB1P46663 353 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 FGL1Q08830 312 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 GID4Q8IVV7 300 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 VNN3Q9NY84 501 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 HMX3A6NHT5 357 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 S1PR4O95977 384 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 ALPPL2P10696 532 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 UQCRC1P31930 480 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 ETV4P43268 484 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 NFATC2Q13469 925 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 OR4D1Q15615 310 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 CARD16Q5EG05 197 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 C1orf74Q96LT6 269 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF597Q96LX8 424 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 PIP5K1AQ99755 562 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 SMOQ99835 787 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 PLSCR1O15162 318 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 FGF19O95750 216 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 PET100P0DJ07 73 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 EVI2BP34910 448 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 NTRK2Q16620 822 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC58Q4VC31 144 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 CMTM8Q8IZV2 173 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 DENND6BQ8NEG7 585 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 TLE6Q9H808 572 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.434e-6■□□□□ 8.5
SBNO1-201ENST00000267176 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 NUAK1O60285 661 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 CAPNS1P04632 268 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 ARHGAP1Q07960 439 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 HYAL2Q12891 473 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.09□□□□□ -1.43
SBNO1-201ENST00000267176 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
SBNO1-201ENST00000267176 ERVK-21P61565 698 aa6.09□□□□□ -1.44
SBNO1-201ENST00000267176 FAM189BP81408 668 aa6.09□□□□□ -1.44
SBNO1-201ENST00000267176 GXYLT1Q4G148 440 aa6.09□□□□□ -1.44
SBNO1-201ENST00000267176 VITQ6UXI7 678 aa6.09□□□□□ -1.44
SBNO1-201ENST00000267176 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.09□□□□□ -1.44
SBNO1-201ENST00000267176 NOXA1Q86UR1 476 aa6.09□□□□□ -1.44
SBNO1-201ENST00000267176 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.09□□□□□ -1.44
SBNO1-201ENST00000267176 PRSS58Q8IYP2 241 aa6.09□□□□□ -1.44
SBNO1-201ENST00000267176 NETO1Q8TDF5 533 aa6.09□□□□□ -1.44
SBNO1-201ENST00000267176 NSMAFQ92636 917 aa6.09□□□□□ -1.44
SBNO1-201ENST00000267176 SUSD3Q96L08 255 aa6.09□□□□□ -1.44
SBNO1-201ENST00000267176 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
SBNO1-201ENST00000267176 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.09□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms