RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 SPATA19Q7Z5L4 167 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SYVN1Q86TM6 617 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC112Q8NEF3 446 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SPATA4Q8NEY3 305 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 OR7G1Q8NGA0 311 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 OR10Z1Q8NGY1 313 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 OR52J3Q8NH60 311 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ASZ1Q8WWH4 475 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SMPDL3BQ92485 455 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SEPT8Q92599 483 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SEMA4DQ92854 862 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SPATA13Q96N96 652 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TESK2Q96S53 571 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 MGME1Q9BQP7 344 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 RHNO1Q9BSD3 238 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 YIPF3Q9GZM5 350 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SNX25Q9H3E2 840 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 KAT14Q9H8E8 782 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SIX2Q9NPC8 291 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 EURLQ9NYK6 297 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 NDUFA13Q9P0J0 144 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TRIM10Q9UDY6 481 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CACNG5Q9UF02 275 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 OSGIN1Q9UJX0 560 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TSPAN16Q9UKR8 245 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 KCNJ14Q9UNX9 436 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CACNG2Q9Y698 323 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 U3KQV3 271 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CPDO75976 1380 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa2.76□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 A0A0U1RQV5 110 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TRBC2A0A5B9 178 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SLCO1B7G3V0H7 640 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 HIP1O00291 1037 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 PLK4O00444 970 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CTDSP2O14595 271 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF197O14709 1029 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SLC22A2O15244 555 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ALOX15BO15296 676 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 PFDN1O60925 122 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TADA2AO75478 443 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CLPXO76031 633 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CDK14O94921 469 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 AGTP01019 485 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 YES1P07947 543 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 UMPSP11172 480 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ERCC2P18074 760 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 VCLP18206 1134 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SP100P23497 879 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 HMOX2P30519 316 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SFNP31947 248 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SLC26A3P40879 764 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ALDH3B1P43353 468 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ACADVLP49748 655 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SMSP52788 366 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SNU13P55769 128 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ITGA9Q13797 1035 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF273Q14593 569 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 MVPQ14764 893 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 FAM83EQ2M2I3 478 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 KLHL40Q2TBA0 621 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 KIAA1644Q3SXP7 199 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 FFAR4Q5NUL3 377 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 CLEC6AQ6EIG7 209 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 NCEH1Q6PIU2 408 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 MOXD1Q6UVY6 613 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF677Q86XU0 584 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF843Q8N446 348 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 NATD1Q8N6N6 113 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 NHLRC2Q8NBF2 726 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 DDHD1Q8NEL9 900 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 OR2T3Q8NH03 318 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 FANK1Q8TC84 345 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 PAQR8Q8TEZ7 354 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 SCFD1Q8WVM8 642 aa2.75□□□□□ -1.97
GPBP1-201ENST00000264779 TNFRSF14Q92956 283 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms