RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 ZNF556Q9HAH1 456 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CD93Q9NPY3 652 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 IFT52Q9Y366 437 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ARHGAP33O14559 1287 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 AQP9O43315 295 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 GPR37L1O60883 481 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 DNAJB6O75190 326 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ADRB3P13945 408 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 FUT1P19526 365 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PRPH2P23942 346 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 IL12RB1P42701 662 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 RGS6P49758 472 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 DSTNP60981 165 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ZNF234Q14588 700 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SSX1Q16384 188 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ZNF404Q494X3 552 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SPIN4Q56A73 249 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 DPPA4Q7L190 304 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 GLCCI1Q86VQ1 547 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SFTPA2Q8IWL1 248 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 OR8H2Q8N162 312 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 LINC01555Q8NAE3 123 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ART5Q96L15 291 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 AICDAQ9GZX7 198 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TMEM245Q9H330 911 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 EGLN3Q9H6Z9 239 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TIGARQ9NQ88 270 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GVC2 190 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 A6NIN4 97 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SOBPA7XYQ1 873 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CCNB2O95067 398 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ZNF30P17039 623 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 GPC1P35052 558 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 MAN2A2P49641 1150 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TMED10P49755 219 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 VEZF1Q14119 521 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 C18orf63Q68DL7 685 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TCTN3Q6NUS6 607 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ERICH5Q6P6B1 374 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 GATAD2AQ86YP4 633 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 OR52E4Q8NGH9 312 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 OR52N2Q8NGI0 321 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 GANCQ8TET4 914 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 KAT2AQ92830 837 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 BADQ92934 168 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 NECTIN4Q96NY8 510 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 MGLLQ99685 303 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PIP5K1AQ99755 562 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 MROQ9BYG7 248 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ABCB9Q9NP78 766 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 LHX9Q9NQ69 397 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CNIH4Q9P003 139 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 INSL6Q9Y581 213 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 IRAK3Q9Y616 596 aa8.24□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PLD2O14939 933 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CISD3P0C7P0 127 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ASMTP46597 345 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 RFX3P48380 749 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 LTB4RQ15722 352 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SMU1Q2TAY7 513 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ATL1Q8WXF7 558 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ZNF566Q969W8 418 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 FCRL1Q96LA6 429 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 EPYCQ99645 322 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TTTY10Q9BZA0 68 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 EHD3Q9NZN3 535 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 BTNL2Q9UIR0 455 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 ADAMDEC1O15204 470 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 MID1O15344 667 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 NCR1O76036 304 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 CSF2P04141 144 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 IFNW1P05000 195 aa8.23□□□□□ -1.09
GINS1-201ENST00000262460 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms