RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 GLOD5A6NK44 160 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 MID1O15344 667 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 PDPK1O15530 556 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 SH3BP5O60239 455 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 MFN2O95140 757 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 IFNA14P01570 189 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 CSNK2BP67870 215 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 TP53BP2Q13625 1128 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 UAP1L1Q3KQV9 507 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 ADCK2Q7Z695 626 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 PPP1R14BQ96C90 147 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 OR5M11Q96RB7 305 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 IL4I1Q96RQ9 567 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 NEURL2Q9BR09 285 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 AHSPQ9NZD4 102 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 SPATA7Q9P0W8 599 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 PRR23AA6NEV1 266 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 C5orf58C9J3I9 102 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 CCR8P51685 355 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 SYPL1Q16563 259 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 TCTN3Q6NUS6 607 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 TAGAPQ8N103 731 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 CHFRQ96EP1 664 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 CENPOQ9BU64 300 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 DSN1Q9H410 356 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 C11orf16Q9NQ32 467 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 FTSJ1Q9UET6 329 aa18.26■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 ALPPL2P10696 532 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 DBTP11182 482 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 ACP5P13686 325 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 SERPINB10P48595 397 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 SPDYE7PQ495Y7 208 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 FRMPD2BQ6IN97 320 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 DEF8Q6ZN54 512 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 DENND6BQ8NEG7 585 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 MCFD2Q8NI22 146 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 OR5P2Q8WZ92 322 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 SMARCD2Q92925 531 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 MROQ9BYG7 248 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 KRBA1A5PL33 1030 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 ANHXE9PGG2 379 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 TPST2O60704 377 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 HEPACAMQ14CZ8 416 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 ARMCX4Q5H9R4 360 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 NIPAL1Q6NVV3 410 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 EGFL6Q8IUX8 553 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 CLIP4Q8N3C7 705 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 S100ZQ8WXG8 99 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 C17orf62Q9BQA9 187 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 KLHL31Q9H511 634 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 WASH6PQ9NQA3 447 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 KCND3Q9UK17 655 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 COL4A3Q01955 1670 aa18.25■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 DSCR3O14972 297 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 OR12D1P0DN82 309 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 CRISP1P54107 249 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 RPA4Q13156 261 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 FGL2Q14314 439 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF750Q32MQ0 723 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 PTCHD4Q6ZW05 846 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 DEPDC4Q8N2C3 294 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 FERD3LQ96RJ6 166 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 HDAC8Q9BY41 377 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 KCNK6Q9Y257 313 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 ZAR1LA6NP61 321 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 C4orf51C9J302 202 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 NDUFS4O43181 175 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 CDH3P22223 829 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 CSNK1G2P78368 415 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 REEP5Q00765 189 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 TCEA2Q15560 299 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 COLEC12Q5KU26 742 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 AGBL4Q5VU57 503 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF793Q6ZN11 406 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 PSMA8Q8TAA3 256 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 SMPDL3AQ92484 453 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 FCGR1BQ92637 280 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 C12orf66Q96MD2 445 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa18.24■□□□□ 0.51
LPCAT3-201ENST00000261407 YIPF4Q9BSR8 244 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms