RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248121.6

SYNGR3-201, Transcript of synaptogyrin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNGR3, Length 2,051 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3-201ENST00000248121 NLNQ9BYT8 704 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 DOLKQ9UPQ8 538 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ATG4BQ9Y4P1 393 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 SCN3AQ9NY46 2000 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 A0A1W2PR48 441 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ZW10O43264 779 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 FKBP9O95302 570 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 FABP3P05413 133 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 THRBP10828 461 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 DRD2P14416 443 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 CERS1P27544 350 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 SLC9A5Q14940 896 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PLK5Q496M5 336 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 OR2T5Q6IEZ7 315 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 GKN2Q86XP6 184 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ARL14Q8N4G2 192 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 KCT2Q8NC54 265 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 OR2T29Q8NH02 315 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 NEURL3Q96EH8 262 aa22.1■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 GLOD5A6NK44 160 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 TNFSF14O43557 240 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 CTSVO60911 334 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 OPN1SWP03999 348 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ARFIP1P53367 373 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 RPS26P62854 115 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 FCRL6Q6DN72 434 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 CEP68Q76N32 757 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 TAMM41Q96BW9 452 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 SDCCAG3Q96C92 435 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 NEUROD4Q9HD90 331 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 EHD3Q9NZN3 535 aa22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 H0YAE9 185 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 SUV39H1O43463 412 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 E2F6O75461 281 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ARAFP10398 606 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ATP6V1B1P15313 513 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PRIM2P49643 509 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 CDK6Q00534 326 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 SHBQ15464 509 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 LIN52Q52LA3 116 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 CCDC80Q76M96 950 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PSMA8Q8TAA3 256 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 DOHHQ9BU89 302 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 RAD21L1Q9H4I0 556 aa22.08■■□□□ 1.13
SYNGR3-201ENST00000248121 PGRMC2O15173 223 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 CLPTM1O96005 669 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 ALBP02768 609 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 SELENOWP63302 87 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 METTL25Q8N6Q8 603 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 HORMAD2Q8N7B1 307 aa22.08■■□□□ 1.12
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SYNGR3-201ENST00000248121 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 OR2A5Q96R48 311 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 MBOAT4Q96T53 435 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
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SYNGR3-201ENST00000248121 TOR3AQ9H497 397 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 GLIPR2Q9H4G4 154 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 HRASLS2Q9NWW9 162 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 ADPRHL2Q9NX46 363 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 MYRFQ9Y2G1 1151 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.08■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 LMO7DNF2Z398 122 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 CTSKP43235 329 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 LAPTM4AQ15012 233 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 MLC1Q15049 377 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 C18orf63Q68DL7 685 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 SATL1Q86VE3 508 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 AMDHD1Q96NU7 426 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 PADI4Q9UM07 663 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 TTC28Q96AY4 2481 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 SH3BP5O60239 455 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 AIFM1O95831 613 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 MYF5P13349 255 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 DDX5P17844 614 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 DSTNP60981 165 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 HIPK1Q86Z02 1210 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 SLC25A45Q8N413 288 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 DTWD2Q8NBA8 298 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 TM4SF19Q96DZ7 209 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 RDH12Q96NR8 316 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 FAIM2Q9BWQ8 316 aa22.07■■□□□ 1.12
SYNGR3-201ENST00000248121 FBXW2Q9UKT8 454 aa22.07■■□□□ 1.12
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