RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 NLGN3Q9NZ94 848 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL42Q9P2K6 505 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 U3KQV3 271 aa25.08■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 NCOR2Q9Y618 2525 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM20BO75063 409 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 MT-ND2P03891 347 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 HMGCS1Q01581 520 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 GGTA1PQ4G0N0 100 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf96Q7Z7L8 435 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN19Q8N6F1 224 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM46DQ8NEK8 389 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TOR4AQ9NXH8 423 aa25.07■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2A25A4D2G3 310 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 FFAR3O14843 346 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR42O15529 346 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SEMG1P04279 462 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 FABP3P05413 133 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 CBSLP0DN79 551 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 PTPN6P29350 595 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 CBSP35520 551 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM220Q6QAJ8 160 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 HPS1Q92902 700 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC38A4Q969I6 547 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SIGLEC11Q96RL6 698 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 BTBD2Q9BX70 525 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SERTM1A2A2V5 107 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 STK16O75716 305 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 GUCA1CO95843 209 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SDHBP21912 280 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ACRV1P26436 265 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTR1BP42025 376 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP2K4P45985 399 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 MASP1P48740 699 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTR1AP61163 376 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 GBX1Q14549 363 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 GTDC1Q4AE62 458 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC157Q569K6 752 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35F3Q8IY50 421 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB2Q8N680 514 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA9Q9BWV2 254 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ITPAQ9BY32 194 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 DPEP2Q9H4A9 486 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 LATS2Q9NRM7 1088 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TAAR2Q9P1P5 351 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS21Q9Y6M0 314 aa25.06■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 E9PQ18 207 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 VEGFDO43915 354 aa25.05■■□□□ 1.6
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CAPNS1-201ENST00000246533 UPK1BO75841 260 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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CAPNS1-201ENST00000246533 TCAIMQ8N3R3 496 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 MCFD2Q8NI22 146 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 CMTM7Q96FZ5 175 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC32A1Q9H598 525 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 EXD2Q9NVH0 621 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 VNN3Q9NY84 501 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 GULP1Q9UBP9 304 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 FTSJ1Q9UET6 329 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX6Q9UNH7 406 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 EFCAB9A8MZ26 197 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 PRMT3O60678 531 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 CEACAM1P13688 526 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 PHC1P78364 1004 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
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CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC81Q6ZN84 652 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 PAGE2Q7Z2X7 111 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 GKN2Q86XP6 184 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TXNDC15Q96J42 360 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 COPS8Q99627 209 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL25Q9H0H3 589 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT84Q9NSB2 600 aa25.04■■□□□ 1.6
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CAPNS1-201ENST00000246533 KIF17Q9P2E2 1029 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR34Q9UPC5 381 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 B4DGG1 531 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 RFXANKO14593 260 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 CD36P16671 472 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 GTF2H3Q13889 308 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFA5Q16718 116 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 FAHD1Q6P587 224 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRTM4Q86VH4 590 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC22A16Q86VW1 577 aa25.04■■□□□ 1.6
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