RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218348.7

USP11-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-201ENST00000218348 DGCR6Q14129 220 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 MOGQ16653 247 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TMEM52BQ4KMG9 183 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 OR2T5Q6IEZ7 315 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ENPP7Q6UWV6 458 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 NLGN4XQ8N0W4 816 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 OR8J2Q8NGG1 315 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 OR2T29Q8NH02 315 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TAMM41Q96BW9 452 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 KCNC2Q96PR1 638 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 DHRS9Q9BPW9 319 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SP140LQ9H930 580 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 FGF22Q9HCT0 170 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PLXNA2O75051 1894 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ISM1B1AKI9 464 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 VEGFDO43915 354 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 UGDHO60701 494 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 KLHL18O94889 574 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 FURINP09958 794 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PTNP21246 168 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ASMTP46597 345 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 DAPP51397 102 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ARHGDIAP52565 204 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CRYBA2P53672 197 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CDH12P55289 794 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CD83Q01151 205 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 OCA2Q04671 838 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 DPTQ07507 201 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 RAB39AQ14964 217 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CPZQ66K79 652 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 THAP5Q7Z6K1 395 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 RASGRP3Q8IV61 690 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SHISA5Q8N114 240 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ZFP90Q8TF47 636 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 DNASE1L2Q92874 299 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 REPS1Q96D71 796 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PLEKHA8Q96JA3 519 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 DMTF1Q9Y222 760 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PRAMEF10O60809 474 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SCO1O75880 301 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 VIPP01282 170 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 C9P02748 559 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ASGR2P07307 311 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 RETP07949 1114 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 GPX2P18283 190 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 POU1F1P28069 291 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 ACSL1P33121 698 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CORO6Q6QEF8 472 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 GALNT13Q8IUC8 556 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 LURAP1LQ8IV03 231 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 KRT78Q8N1N4 520 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 OR5K1Q8NHB7 308 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PATE1Q8WXA2 126 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PDXPQ96GD0 296 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 REEP1Q9H902 201 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 BRF2Q9HAW0 419 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TAAR2Q9P1P5 351 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CPNE7Q9UBL6 633 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TRPC4Q9UBN4 977 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 PFDN2Q9UHV9 154 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 GPR34Q9UPC5 381 aa9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.47□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 A0A1W2PPW3 197 aa9.47□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 BCKDKO14874 412 aa9.47□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TMPRSS11DO60235 418 aa9.47□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 GPC1P35052 558 aa9.47□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SSR2P43308 183 aa9.47□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
USP11-201ENST00000218348 SPATS1Q496A3 300 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms