RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000008440.9

SPRTN-201, Transcript of SprT-like N-terminal domain, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPRTN, Length 1,667 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTN-201ENST00000008440 CBX1P83916 185 aa20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 PAOXQ6QHF9 649 aa20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 RIMKLAQ8IXN7 391 aa20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 MIER2Q8N344 545 aa20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 OR2Y1Q8NGV0 311 aa20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 BCAS4Q8TDM0 211 aa20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 TANKQ92844 425 aa20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 KLHL29Q96CT2 875 aa20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 MESP1Q9BRJ9 268 aa20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 GPR87Q9BY21 358 aa20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 SH3BP4Q9P0V3 963 aa20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 UTS2RQ9UKP6 389 aa20.08■□□□□ 0.81
SPRTN-201ENST00000008440 GABRR3A8MPY1 467 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 CTNSO60931 367 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 PRPS1L1P21108 318 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 HPCAL1P37235 193 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 EMP2P54851 167 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 HSD17B7P56937 341 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 UGT8Q16880 541 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 ZNF750Q32MQ0 723 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 QSOX2Q6ZRP7 698 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 MED25Q71SY5 747 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 KCNE4Q8WWG9 221 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 PRDM9Q9NQV7 894 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 CLDN16Q9Y5I7 305 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 NDUFAB1O14561 156 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 CD63P08962 238 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 C1QTNF9P0C862 333 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 COX7A2P14406 83 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 GPX3P22352 226 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 IL12AP29459 219 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 STX4Q12846 297 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 NSDHLQ15738 373 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 ZNF385BQ569K4 471 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 LANCL3Q6ZV70 420 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 FAM9CQ8IZT9 166 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 ZNF385DQ9H6B1 395 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 KCND3Q9UK17 655 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 MMACHCQ9Y4U1 282 aa20.07■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 BLACEA4D250 179 aa20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 SLC22A3O75751 556 aa20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 CD1EP15812 388 aa20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 PIK3R1P27986 724 aa20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 FEN1P39748 380 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 SQLEQ14534 574 aa20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 PGS1Q32NB8 556 aa20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 OR4K14Q8NGD5 310 aa20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 PPCDCQ96CD2 204 aa20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 EHD3Q9NZN3 535 aa20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 DKK4Q9UBT3 224 aa20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 PSME2Q9UL46 239 aa20.06■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 KLK10O43240 276 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 ALOX12BO75342 701 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 GPR75O95800 540 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 LAMP1P11279 417 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 PPP2R1BP30154 601 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 XKP51811 444 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 PDE7AQ13946 482 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 PLPP5Q8NEB5 264 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 SAR1AQ9NR31 198 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 ZIM2Q9NZV7 527 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 CCDC167Q9P0B6 97 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 ATP6V1HQ9UI12 483 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 LOC400499M0QZD8 3231 aa20.05■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa20.04■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 CAPNS1P04632 268 aa20.04■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 OTX2P32243 289 aa20.04■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 PTGER1P34995 402 aa20.04■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 ATP4BP51164 291 aa20.04■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 DUSP2Q05923 314 aa20.04■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 IL10RAQ13651 578 aa20.04■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 CPTPQ5TA50 214 aa20.04■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 C8orf44Q96CB5 159 aa20.04■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 MTERF3Q96E29 417 aa20.04■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 CLMPQ9H6B4 373 aa20.04■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 ARMCX1Q9P291 453 aa20.04■□□□□ 0.8
SPRTN-201ENST00000008440 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms