RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Agpat5Q9D1E8 365 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plpp6Q9D4F2 292 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tor1aQ9ER39 333 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdc20Q9JJ66 499 aa12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col4a4Q9QZR9 1682 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930595M18RikA2RRY9 829 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr287E9PZS7 322 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r4K7N784 913 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-AaP01910 256 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ly6aP05533 134 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxd4P10628 250 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rrm2P11157 390 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defa-rs12P50716 91 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C2cd4cC2CD4Q5HZI2 419 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajc11Q5U458 559 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r39Q7TQA5 319 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PstkQ8BP74 359 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpne3Q8BT60 533 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ScaiQ8C8N2 606 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifnl3Q8CGK6 193 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atat1Q8K341 421 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Utp6Q8VCY6 597 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1276Q8VF40 312 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 St3gal4Q91Y74 333 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MlycdQ99J39 492 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Jph3Q9ET77 744 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plscr3Q9JIZ9 296 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfap5Q9QZJ6 164 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-BlV9GXR0 257 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd300ld2A2A7W0 305 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup18A2BIM8 181 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Iqca1lA6H690 825 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10608E9PZ13 166 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r25H3BLP0 302 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dgcr6O35347 198 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sap18O55128 153 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup11P04938 181 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Surf2P09926 257 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zic1P46684 447 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcyt1aP49586 367 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc1a5P51912 553 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Entpd1P55772 510 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Erp29P57759 262 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GiprQ0P543 460 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D13Ertd608eQ3UPR8 151 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21320Q4FZE8 181 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il18r1Q61098 537 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam189a1Q6A044 515 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim50Q810I2 483 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8BGK9 164 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8BH50 245 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndrg4Q8BTG7 352 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smco1Q8CEZ1 214 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NrmQ8VC65 262 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mri1Q9CQT1 369 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr701Q9D3U9 316 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ern1Q9EQY0 977 aa12.09□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Golga4Q91VW5 2238 aa12.08□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A1L1STL9 112 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shisa8J3QNX5 399 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp1P08042 402 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ncam1P13595 1115 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EnpepP16406 945 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FasP25446 327 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csf2rbP26955 896 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fpr1P33766 364 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tbx1P70323 479 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf770Q8BIQ8 705 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aifm2Q8BUE4 373 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prkd3Q8K1Y2 889 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r201Q8R262 300 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chrna3Q8R4G9 499 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Neto1Q8R4I7 533 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1414Q8VGU5 312 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif2b2Q99LD9 351 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp6ap1lD3Z5W0 336 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xkr6E9Q6C8 638 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r92L7N2A4 860 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cops4O88544 406 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajb5O89114 348 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gsta2P10648 222 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp37P17141 594 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Guca1aP43081 202 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Epb42P49222 691 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccr3P51678 359 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HccsP53702 272 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lhx1P63006 406 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnaja1P63037 397 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gfi1P70338 423 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scgb1a1Q06318 96 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam98aQ3TJZ6 515 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm14226Q3TZL0 686 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tstd2Q3U269 495 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P2rx5Q3UYI1 455 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sel1l2Q3V172 688 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il20raQ6PHB0 546 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igsf5Q7TSN7 370 aa12.08□□□□□ -0.48
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krr1Q8BGA5 380 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.8 ms