RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635853.1

SPTAN1-228, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 5,870 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-228ENST00000635853 NRP1O14786 923 aa9.49□□□□□ -0.89
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SPTAN1-228ENST00000635853 C3P1Q6ZMU1 363 aa9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPTAN1-228ENST00000635853 ZNF709Q8N972 641 aa9.48□□□□□ -0.89
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