RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	FGF13	Q92913	245 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	MTERF3	Q96E29	417 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM19	Q96HH6	336 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	THSD1	Q9NS62	852 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-222	ENST00000635152	SOBP	A7XYQ1	873 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CCNB2	O95067	398 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RECK	O95980	971 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	GADD45A	P24522	165 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC80	Q76M96	950 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SLC38A4	Q969I6	547 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ASB16	Q96NS5	453 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		12.46	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	GLOD5	A6NK44	160 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152		E9PQ18	207 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	FFAR1	O14842	300 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PDPK1	O15530	556 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TMPRSS11D	O60235	418 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SOX14	O95416	240 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PTH	P01270	115 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CDK1	P06493	297 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ACP5	P13686	325 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	BSG	P35613	385 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TCEA2	Q15560	299 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF675	Q8TD23	568 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MYDGF	Q969H8	173 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	VMP1	Q96GC9	406 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MS4A8	Q9BY19	250 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MID1	O15344	667 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	B4GALT2	O60909	372 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DNASE1L3	Q13609	305 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	DEF8	Q6ZN54	512 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RTL10	Q7L3V2	364 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	POLE4	Q9NR33	117 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		12.45	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM221	A6NGB7	291 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	TPST2	O60704	377 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	ALPPL2	P10696	532 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	RHCE	P18577	417 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	GRK5	P34947	590 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	BCAP31	P51572	246 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CCR8	P51685	355 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	CSNK2B	P67870	215 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	MCFD2	Q8NI22	146 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	SMARCD2	Q92925	531 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	COX14	Q96I36	57 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	BTBD2	Q9BX70	525 aa		12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
BRF1-222	ENST00000635152	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		12.44	□□□□□ -0.42

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