RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617172.4

TARDBP-218, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-218ENST00000617172 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 ACTR8Q9H981 624 aa9□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 HPF1Q9NWY4 346 aa9□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 COPS7AQ9UBW8 275 aa9□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 PHF11Q9UIL8 331 aa9□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa9□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 TINAGQ9UJW2 476 aa9□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 TMCO1Q9UM00 188 aa9□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 MEMO1Q9Y316 297 aa9□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 ASB1Q9Y576 335 aa9□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 IKBKGQ9Y6K9 419 aa9□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 ESYT3A0FGR9 886 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 HMX2A2RU54 273 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 C17orf105B2RV13 164 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 E9PLN8 166 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 LDB3O75112 727 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 URI1O94763 535 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 INHBAP08476 426 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 RBP1P09455 135 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 COL6A2P12110 1019 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 CNTFP26441 200 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 PTGS2P35354 604 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 SERPINB8P50452 374 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 SERPINB9P50453 376 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 RNF4P78317 190 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 CUL3Q13618 768 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 GTF2H2Q13888 395 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 MPEG1Q2M385 716 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 OPN5Q6U736 354 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 TAOK1Q7L7X3 1001 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 MDGA2Q7Z553 956 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 L3MBTL4Q8NA19 623 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 AGAP11Q8TF27 550 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 ART5Q96L15 291 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 CSF3RQ99062 836 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 VKORC1Q9BQB6 163 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 OR8D2Q9GZM6 311 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 OR51B5Q9H339 312 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 IPPKQ9H8X2 491 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 DMRT3Q9NQL9 472 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.99□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 TMEM200CA6NKL6 621 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 ACOT7O00154 380 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 WWP2O00308 870 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 RTCAO00442 366 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 PROM1O43490 865 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 KRT38O76015 456 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 CLDN9O95484 217 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 CNR1P21554 472 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 PTGER4P35408 488 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 GMPRP36959 345 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 STT3AP46977 705 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 HK2P52789 917 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 IRF9Q00978 393 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 PLIN5Q00G26 463 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 TMEM211Q6ICI0 200 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 CYP20A1Q6UW02 462 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 IL20RBQ6UXL0 311 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 RTL4Q6ZR62 310 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 GK5Q6ZS86 529 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 CNPY4Q8N129 248 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 SLC15A4Q8N697 577 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 NUBPLQ8TB37 319 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 SLC44A1Q8WWI5 657 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 ATP6V1E2Q96A05 226 aa8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
TARDBP-218ENST00000617172 GPR78Q96P69 363 aa8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms