RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611636.4

WHAMMP3-201, Transcript of WAS protein homolog associated with actin, golgi membranes and microtubules pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene WHAMMP3, Length 1,609 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3-201ENST00000611636 B4E171 279 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 TIAF1O95411 115 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 RNH1P13489 461 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 CEACAM1P13688 526 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 TSPAN7P41732 249 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 SHC2P98077 582 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 ART3Q13508 389 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 ANXA8L1Q5VT79 327 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 RHBDD2Q6NTF9 364 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 PRMT9Q6P2P2 845 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 SLC2A7Q6PXP3 512 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 RINLQ6ZS11 566 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 FAM47BQ8NA70 645 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 VPS37AQ8NEZ2 397 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 UCN3Q969E3 161 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 CSF3RQ99062 836 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 CTRCQ99895 268 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 C5AR2Q9P296 337 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 PGRMC2O15173 223 aa23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 HBQ1P09105 142 aa23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 PAGE3Q5JUK9 113 aa23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 SLC48A1Q6P1K1 146 aa23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 RAB11FIP2Q7L804 512 aa23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 FBXO27Q8NI29 283 aa23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 CLIP3Q96DZ5 547 aa23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 PRDM9Q9NQV7 894 aa23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 SLC39A1Q9NY26 324 aa23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 TAS2R7Q9NYW3 318 aa23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 MAP10Q9P2G4 905 aa23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 UTS2RQ9UKP6 389 aa23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 MAU2Q9Y6X3 613 aa23.46■■□□□ 1.35
WHAMMP3-201ENST00000611636 WNT3P56703 355 aa23.45■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 PRSS53Q2L4Q9 553 aa23.45■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 C1orf189Q5VU69 101 aa23.45■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 OR52E8Q6IFG1 317 aa23.45■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 ANKRD46Q86W74 232 aa23.45■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 NATD1Q8N6N6 113 aa23.45■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa23.45■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 ITCHQ96J02 903 aa23.45■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 C1orf21Q9H246 121 aa23.45■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 ZNF304Q9HCX3 659 aa23.45■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 TAS2R1Q9NYW7 299 aa23.45■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 PSME2Q9UL46 239 aa23.45■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 CYR61O00622 381 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 GYG2O15488 501 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 OR1D4P47884 311 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 ID4P47928 161 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 PLIN5Q00G26 463 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 NFYCQ13952 458 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 SYT16Q17RD7 645 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 DPP10Q8N608 796 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 GTF2H4Q92759 462 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 COL26A1Q96A83 441 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 ROPN1LQ96C74 230 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 PEX11GQ96HA9 241 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 GID8Q9NWU2 228 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 CES1P1Q9UKY3 287 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 DCHS1Q96JQ0 3298 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 KNTC1P50748 2209 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 SPTBN4Q9H254 2564 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 CCDC187A0A096LP49 1063 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 PDPK1O15530 556 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 SCN2BO60939 215 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 FBLP22087 321 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 RAB15P59190 212 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 SLC25A3Q00325 362 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 LRRC74AQ0VAA2 488 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 DSG2Q14126 1118 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 MPEG1Q2M385 716 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 DNAL1Q4LDG9 190 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 C6orf10Q5SRN2 563 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 OR51Q1Q8NH59 317 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 DNAJB14Q8TBM8 379 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 IL1RL2Q9HB29 575 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 NDE1Q9NXR1 346 aa23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 WASHC1A8K0Z3 465 aa23.43■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 FAM227AF5H4B4 570 aa23.43■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 KCNH1O95259 989 aa23.43■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 NTRK1P04629 796 aa23.43■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 ITIH1P19827 911 aa23.43■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 ITGAXP20702 1163 aa23.43■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 CPOXP36551 454 aa23.43■■□□□ 1.34
WHAMMP3-201ENST00000611636 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms