RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, human

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGEF1-209	ENST00000607882	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	ACTL8	Q9H568	366 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	PADI1	Q9ULC6	663 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	TENM4	Q6N022	2769 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882		K7ENP7	123 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	PLOD2	O00469	737 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	ALOX12B	O75342	701 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	HNF4A	P41235	474 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	STAT5A	P42229	794 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	KCNC1	P48547	511 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	KIR2DS3	Q14952	304 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	CARM1	Q86X55	608 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCDC126	Q96EE4	140 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	C3orf30	Q96M34	536 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	DPH1	Q9BZG8	443 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	LIN28A	Q9H9Z2	209 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMCO1	Q9UM00	188 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	BTRC	Q9Y297	605 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RABGEF1-209	ENST00000607882		E7EQ34	232 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	GFY	I3L273	518 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	AKAP10	O43572	662 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	PIP5K1C	O60331	668 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	SLC7A1	P30825	629 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	RGS4	P49798	205 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	ITGA1	P56199	1179 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	EGFL8	Q99944	293 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	INIP	Q9NRY2	104 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	CD300A	Q9UGN4	299 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	HAT1	O14929	419 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	SH3BGRL	O75368	114 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	H6PD	O95479	791 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	SERPIND1	P05546	499 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	RBP1	P09455	135 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	ATP6V1B2	P21281	511 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	HAAO	P46952	286 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	IL10RA	Q13651	578 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	RETREG3	Q86VR2	466 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	DHFR2	Q86XF0	187 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	SERINC2	Q96SA4	455 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	AURKC	Q9UQB9	309 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	ASB1	Q9Y576	335 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	SVIL	O95425	2214 aa		11.89	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	POM121C	A8CG34	1229 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	NR5A2	O00482	541 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	PPP6C	O00743	305 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	SOCS2	O14508	198 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	TPST1	O60507	370 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	ZNF23	P17027	643 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	GABRA4	P48169	554 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	CDH15	P55291	814 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	ACAP2	Q15057	778 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	SYT16	Q17RD7	645 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	SBSN	Q6UWP8	590 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	LARP4	Q71RC2	724 aa	Known RBP eCLIP	11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	C19orf60	Q96EN9	201 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	TCTN2	Q96GX1	697 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	CCDC138	Q96M89	665 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	HAUS8	Q9BT25	410 aa		11.88	□□□□□ -0.51
RABGEF1-209	ENST00000607882	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		11.88	□□□□□ -0.51

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