RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 CAMK2AQ9UQM7 478 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM64A6NGJ6 449 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM64BA6NI03 449 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 C17orf105B2RV13 164 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 GDF1P27539 372 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 CPA2P48052 419 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 KIF5AQ12840 1032 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 CBLBQ13191 982 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 PAQR3Q6TCH7 311 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM13CQ8NE31 585 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC22A8Q8TCC7 542 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC2A12Q8TD20 617 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 ACKR4Q9NPB9 350 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 CLDN16Q9Y5I7 305 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 MAGEB16A2A368 324 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 RNF212BA8MTL3 300 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TRAPPC6AO75865 159 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 BMP7P18075 431 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 CTSSP25774 331 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 OPRM1P35372 400 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 VPS41P49754 854 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 PLA2G16P53816 162 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 AP1S2P56377 157 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 DUSP8Q13202 625 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 RCN2Q14257 317 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 POMZP3Q6PJE2 187 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 NXPE4Q6UWF7 544 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 PM20D2Q8IYS1 436 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 OR8K3Q8NH51 312 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 PERPQ96FX8 193 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 DACH2Q96NX9 599 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM5Q9C035 493 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 PRM3Q9NNZ6 103 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PPR1 153 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 SH3D21A4FU49 640 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 CTNSO60931 367 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 ERN1O75460 977 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 CCNG2Q16589 344 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 LMNTD2Q8IXW0 634 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 FBXL8Q96CD0 374 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 CSF3RQ99062 836 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 AICDAQ9GZX7 198 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 QPCTLQ9NXS2 382 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 VTI1BQ9UEU0 232 aa20.02■□□□□ 0.8
CAPNS1-205ENST00000588780 SDR42E2A6NKP2 422 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 LRATO95237 230 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 IL2P60568 153 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.794e-8■■■■■ 41.9
CAPNS1-205ENST00000588780 PIGGQ5H8A4 983 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 ARMC3Q5W041 872 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 SMPDL3BQ92485 455 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 ISL2Q96A47 359 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 TIMP4Q99727 224 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 CCL19Q99731 98 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 DOHHQ9BU89 302 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 KCNE2Q9Y6J6 123 aa20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRC3CA6NJW4 275 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 C8BP07358 591 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 KCNJ1P48048 391 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 ID2Q02363 134 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 TOMM20Q15388 145 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 MPEG1Q2M385 716 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM40Q6P9F5 258 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 PRSS57Q6UWY2 283 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 LUZP2Q86TE4 346 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 TXLNBQ8N3L3 684 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 PAQR8Q8TEZ7 354 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 MS4A6EQ96DS6 147 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 PIP5K1AQ99755 562 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM167BQ9BTA0 163 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 UBTD1Q9HAC8 227 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC22A14Q9Y267 594 aa20■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 GOLGA8MH3BSY2 632 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 LDB3O75112 727 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-205ENST00000588780 COX7A2P14406 83 aa19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms