RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 DYTNA2CJ06 578 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 WASHC1A8K0Z3 465 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 FGF17O60258 216 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 WISP1O95388 367 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 IFNA16P05015 189 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 KLK1P06870 262 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 CHN1P15882 459 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 CREB1P16220 341 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 HTR6P50406 440 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 PKNOX1P55347 436 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 DNAJB13P59910 316 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 C10orf107Q8IVU9 208 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 BEST3Q8N1M1 668 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 METTL4Q8N3J2 472 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 APCDD1LQ8NCL9 501 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 HAS2Q92819 552 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF354BQ96LW1 612 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC29A3Q9BZD2 475 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 BRF2Q9HAW0 419 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 MID1IP1Q9NPA3 183 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 ADAP2Q9NPF8 381 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP10Q9P2G4 905 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC17A7Q9P2U7 560 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TEKT2Q9UIF3 430 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 PHF11Q9UIL8 331 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 STK38LQ9Y2H1 464 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TIMM22Q9Y584 194 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa17.38■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 BLACEA4D250 179 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 GLOD5A6NK44 160 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 ESRRBO95718 433 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 KRT6AP02538 564 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 KRT6BP04259 564 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TUBBP07437 444 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 HMOX2P30519 316 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 KRT6CP48668 564 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TNFSF10P50591 281 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 FOXA1P55317 472 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 PCLAFQ15004 111 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TLR1Q15399 786 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TERF2Q15554 542 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 KRT71Q3SY84 523 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 CFAP157Q5JU67 520 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 FRMD7Q6ZUT3 714 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 COMMD6Q7Z4G1 85 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 IQCKQ8N0W5 287 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC5A8Q8N695 610 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 B3GNT7Q8NFL0 401 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 OR1N1Q8NGS0 311 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM111AQ96PZ2 611 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 CDCP1Q9H5V8 836 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 AHSPQ9NZD4 102 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 VTI1BQ9UEU0 232 aa17.37■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 ULK1O75385 1050 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 AIFM1O95831 613 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 ENO1P06733 434 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TNNI3P19429 210 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 GPR143P51810 404 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TAS2R50P59544 299 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 FOLH1Q04609 750 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 SERTAD2Q14140 314 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 MEP1AQ16819 746 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 LIPMQ5VYY2 423 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 SCIMPQ6UWF3 145 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TCP10LQ8TDR4 215 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TANKQ92844 425 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 NCLNQ969V3 563 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 SMC6Q96SB8 1091 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 RNF32Q9H0A6 362 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 ANKRD10Q9NXR5 420 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 NTNG1Q9Y2I2 539 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 BAHCC1Q9P281 2608 aa17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 ARHGAP10A1A4S6 786 aa17.35■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 OR5H15A6NDH6 313 aa17.35■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 NR2F6P10588 404 aa17.35■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa17.35■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 PAGE2Q7Z2X7 111 aa17.35■□□□□ 0.37
GCSHP2-201ENST00000560971 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms