RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CTNSO60931 367 aa22.52■■□□□ 1.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GALNTL6Q49A17 601 aa22.52■■□□□ 1.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CLNKQ7Z7G1 428 aa22.52■■□□□ 1.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TM4SF18Q96CE8 201 aa22.52■■□□□ 1.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FCRL1Q96LA6 429 aa22.52■■□□□ 1.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa22.52■■□□□ 1.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C7orf26Q96N11 449 aa22.52■■□□□ 1.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.52■■□□□ 1.2
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARGFXA6NJG6 315 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATP6AP2O75787 350 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ITGB2P05107 769 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 COX6A1P12074 109 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPP2R1BP30154 601 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GSTM5P46439 218 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RRADP55042 308 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RPL38P63173 70 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NOXRED1Q6NXP6 359 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TANKQ92844 425 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CLDN16Q9Y5I7 305 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KCNMB2Q9Y691 235 aa22.51■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLCO1B7G3V0H7 640 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TGFBR3LH3BV60 316 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LDB3O75112 727 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HPP00738 406 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KITP10721 976 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OR4D2P58180 307 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TAS2R50P59544 299 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF763Q0D2J5 394 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCOLCEQ15113 449 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TBR1Q16650 682 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SFT2D3Q587I9 215 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DCAF10Q5QP82 559 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 OR52E8Q6IFG1 317 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BORAQ6PGQ7 559 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NDUFAF7Q7L592 441 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C16orf78Q8WTQ4 265 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TUBGCP3Q96CW5 907 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAIM2Q9BWQ8 316 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NUF2Q9BZD4 464 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 VTI1BQ9UEU0 232 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GIMAP2Q9UG22 337 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ITPR1Q14643 2758 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MED13Q9UHV7 2174 aa22.5■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C1orf226A1L170 272 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GLOD5A6NK44 160 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HDAC3O15379 428 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FGF17O60258 216 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PEX11AO75192 247 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IL3P08700 152 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HK2P52789 917 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 STX4Q12846 297 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CPZQ66K79 652 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RGS9BPQ6ZS82 235 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C7orf57Q8NEG2 295 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UCN3Q969E3 161 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ING2Q9H160 280 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MEAF6Q9HAF1 191 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MGAQ8IWI9 3026 aa22.49■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CACNA1BQ00975 2339 aa22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RHDQ02161 417 aa22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ID2Q02363 134 aa22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FOLH1Q04609 750 aa22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CHAF1BQ13112 559 aa22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SERTAD2Q14140 314 aa22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C6orf136Q5SQH8 315 aa22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DNAJB14Q8TBM8 379 aa22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EXTL1Q92935 676 aa22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF160Q9HCG1 818 aa22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYNNQ9NPC7 610 aa22.48■■□□□ 1.19
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 LOC400499M0QZD8 3231 aa22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms