RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 DEFB124Q8NES8 71 aa16.29■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR5T3Q8NGG3 340 aa16.29■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM125Q96AQ2 219 aa16.29■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF285Q96NJ3 590 aa16.29■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC115Q96NT0 180 aa16.29■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKRD27Q96NW4 1050 aa16.29■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC6A13Q9NSD5 602 aa16.29■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 CMTM6Q9NX76 183 aa16.29■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.29■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 WASHC1A8K0Z3 465 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 NME4O00746 187 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 RDH16O75452 317 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 NR2F6P10588 404 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDK4P11802 303 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 MANFP55145 182 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACY1Q03154 408 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 IFNEQ86WN2 208 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 NETO1Q8TDF5 533 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 C10orf90Q96M02 699 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 FGF21Q9NSA1 209 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 EHD3Q9NZN3 535 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCMF1Q9P0J7 381 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABCD2Q9UBJ2 740 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM186AA6NE01 2351 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRORSD1PA6NEY8 169 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 ITGA1P56199 1179 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNFRSF17Q02223 184 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM53BQ14153 422 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM214AQ32MH5 1076 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 RUNDC3AQ59EK9 446 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 MSRB3Q8IXL7 192 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 DTWD1Q8N5C7 304 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR1L3Q8NH93 324 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 BBS4Q96RK4 519 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 SH3GL1Q99961 368 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 ECSITQ9BQ95 431 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIF1Q9H611 641 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 LYRM4Q9HD34 91 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 NDOR1Q9UHB4 597 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 PSME2Q9UL46 239 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 VPS4AQ9UN37 437 aa16.28■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 MED26O95402 600 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALAS2P22557 587 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 AVPR1BP47901 424 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 HBA1P69905 142 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 SELPLGQ14242 412 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 NIPAL1Q6NVV3 410 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC48A1Q6P1K1 146 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTLL10Q6ZVT0 673 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 CA13Q8N1Q1 262 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 AGBL5Q8NDL9 886 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR8J3Q8NGG0 315 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSF3RQ99062 836 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 CUTCQ9NTM9 273 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 GIMAP4Q9NUV9 329 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 ENTPD4Q9Y227 616 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 POMPQ9Y244 141 aa16.27■□□□□ 0.2
USP3-AS1-201ENST00000558831 FITM1A5D6W6 292 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 EVPLLA8MZ36 301 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 FOXS1O43638 330 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 C8orf89P0DMQ9 161 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 NTSP30990 170 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCKBRP32239 447 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDX1P52945 283 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 SHC2P98077 582 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 LIPEQ05469 1076 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 TLDC1Q6P9B6 456 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYB5D1Q6P9G0 228 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIML2Q8N7C3 387 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 NDC1Q9BTX1 674 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 STRADBQ9C0K7 418 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALG2Q9H553 416 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 TOR4AQ9NXH8 423 aa16.26■□□□□ 0.19
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAS2R9Q9NYW1 312 aa16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.8 ms