RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557356.5

PSEN1-222, Transcript of presenilin 1, human

TSL 4

Gene PSEN1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSEN1-222	ENST00000557356	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	TRABD2A	Q86V40	505 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	METTL4	Q8N3J2	472 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	BANP	Q8N9N5	519 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM47B	Q8NA70	645 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	TSLP	Q969D9	159 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	APOPT1	Q96IL0	206 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	DGAT2	Q96PD7	388 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	CDK15	Q96Q40	435 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	TMEM237	Q96Q45	408 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	MFRP	Q9BY79	579 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	CLMP	Q9H6B4	373 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356		A0A0A6YYD5	115 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	C1orf226	A1L170	272 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	OR2W5	A6NFC9	320 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356		A8MUA0	341 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	C4orf51	C9J302	202 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	MASP2	O00187	686 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	OR10H2	O60403	315 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	PRAMEF2	O60811	474 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	SH3BGRL	O75368	114 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	MYO1D	O94832	1006 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	PDYN	P01213	254 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	KLK1	P06870	262 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	SLC35E2	P0CK97	266 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	UROS	P10746	265 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	DRD2	P14416	443 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	STT3A	P46977	705 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	CYB561	P49447	251 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	TNFSF10	P50591	281 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	TNFRSF17	Q02223	184 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	KRT71	Q3SY84	523 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	HSDL2	Q6YN16	418 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	OR4K14	Q8NGD5	310 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	MIB2	Q96AX9	1013 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	C5orf34	Q96MH7	638 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	CCT7	Q99832	543 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	MAP10	Q9P2G4	905 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	EMCN	Q9ULC0	261 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	ASB4	Q9Y574	426 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PSEN1-222	ENST00000557356		A0A1W2PR48	441 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSEN1-222	ENST00000557356	GABRR3	A8MPY1	467 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSEN1-222	ENST00000557356	C17orf105	B2RV13	164 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSEN1-222	ENST00000557356	SLC28A1	O00337	649 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSEN1-222	ENST00000557356	DYNC1I1	O14576	645 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSEN1-222	ENST00000557356	TM9SF1	O15321	606 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSEN1-222	ENST00000557356	NPHS1	O60500	1241 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSEN1-222	ENST00000557356	LDB3	O75112	727 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSEN1-222	ENST00000557356	EED	O75530	441 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PSEN1-222	ENST00000557356	RASAL1	O95294	804 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSEN1-222	ENST00000557356	WDPCP	O95876	746 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSEN1-222	ENST00000557356	FGF4	P08620	206 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PSEN1-222	ENST00000557356	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24

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