RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557076.5

SCFD1-223, Transcript of sec1 family domain containing 1, human

TSL 3

Gene SCFD1, Length 743 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCFD1-223	ENST00000557076	DMTN	Q08495	405 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	PTK6	Q13882	451 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF460	Q14592	562 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	PDK1	Q15118	436 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	PDK2	Q15119	407 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	LPAR4	Q99677	370 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076		A0A0J9YVX5	310 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	OR2A25	A4D2G3	310 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076		H0YIG0	161 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	FCHO1	O14526	889 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	CASK	O14936	926 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	CD5L	O43866	347 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	TMCC2	O75069	709 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	PHF2	O75151	1096 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	STATH	P02808	62 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	MYBL1	P10243	752 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	ITGAL	P20701	1170 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	IL10	P22301	178 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	CD40	P25942	277 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	RFC3	P40938	356 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	PRKCI	P41743	596 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	GZMK	P49863	264 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	ITGA8	P53708	1063 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	GRB7	Q14451	532 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC10A1	Q14973	349 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	NSDHL	Q15738	373 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	ACKR1	Q16570	336 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	OR2L3	Q8NG85	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	PERP	Q96FX8	193 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	SMC6	Q96SB8	1091 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SCFD1-223	ENST00000557076	AMBRA1	Q9C0C7	1298 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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