RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.16□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.16□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZVL8 140 aa8.15□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 MMP27Q9H306 513 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.15□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 RNF13O43567 381 aa8.15□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 MLIPQ5VWP3 458 aa8.15□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 RTL6Q6ICC9 239 aa8.15□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 IFNA7P01567 189 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 GJA1P17302 382 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 SLC6A9P48067 706 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 TSC22D1Q15714 1073 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 SPANXN4Q5MJ08 99 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
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