RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	NT5DC2	Q9H857	520 aa		14.95	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	RASSF1	Q9NS23	344 aa		14.95	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	SPAST	Q9UBP0	616 aa		14.95	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		14.95	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	OR1F1	O43749	312 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	KDM1A	O60341	852 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	INAVA	Q3KP66	663 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	ADCK2	Q7Z695	626 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	MFSD4A	Q8N468	514 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	FLCN	Q8NFG4	579 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	PPCDC	Q96CD2	204 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	WDR92	Q96MX6	357 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	AQP9	O43315	295 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	MBTPS2	O43462	519 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	SEMA3D	O95025	777 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	MT-ND2	P03891	347 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	IL3	P08700	152 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	CCDC159	P0C7I6	412 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	SERPINB1	P30740	379 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	GAB1	Q13480	694 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	CARTPT	Q16568	116 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	CPZ	Q66K79	652 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	PLD3	Q8IV08	490 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	PYURF	Q96I23	114 aa		14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC16A6	O15403	523 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	APBB3	O95704	486 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	EML2	O95834	649 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	RYK	P34925	604 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	GSS	P48637	474 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	DAP	P51397	102 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	HBA1	P69905	142 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	MPEG1	Q2M385	716 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	VMAC	Q2NL98	169 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	PTOV1	Q86YD1	416 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	MTERF3	Q96E29	417 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	GIN1	Q9NXP7	522 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	VPS4A	Q9UN37	437 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	CCNDBP1	O95273	360 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	PRO3102	Q9H379	93 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		14.93	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC22A1	O15245	554 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	NTRK1	P04629	796 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	BSG	P35613	385 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	DGUOK	Q16854	277 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	MMP21	Q8N119	569 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	GPR37L1	O60883	481 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	SEMA4F	O95754	770 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	C6orf47	O95873	294 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	LCK	P06239	509 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	IL1RN	P18510	177 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	TGM1	P22735	817 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	PPIB	P23284	216 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	MAPK12	P53778	367 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC35A2	P78381	396 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6ZS52	159 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	PGBD3	Q8N328	593 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	YIPF6	Q96EC8	236 aa		14.92	□□□□□ -0.02
GRSF1-208	ENST00000545193	VMP1	Q96GC9	406 aa		14.92	□□□□□ -0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms