RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 BIDP55957 195 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 ACY1Q03154 408 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 ST3GAL3Q11203 375 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 PTCHD3Q3KNS1 767 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 WSCD1Q658N2 575 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 CHST9Q7L1S5 443 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF546Q86UE3 836 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 PIGZQ86VD9 579 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 FAM58AQ8N1B3 248 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 SYT14Q8NB59 555 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 ACKR4Q9NPB9 350 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 MKS1Q9NXB0 559 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF175Q9Y473 711 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 AGAP14A8MT82 685 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 J3KR12 359 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 J3QR89 54 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 SIX6O95475 246 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 GIFP27352 417 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 NANOGP8Q6NSW7 305 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 MCEMP1Q8IX19 187 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 HMGB4Q8WW32 186 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 MOAP1Q96BY2 351 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 NANOGQ9H9S0 305 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 LRCH4O75427 683 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 PAGE1O75459 146 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 CETPP11597 493 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 MAKP20794 623 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 CMPK1P30085 196 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 GTF2BQ00403 316 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 SORDQ00796 357 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 DSC2Q02487 901 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 NPRL3Q12980 569 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 OR13C3Q8NGS6 347 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 SMPDL3AQ92484 453 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 FCRL1Q96LA6 429 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 RNF32Q9H0A6 362 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 MCCC2Q9HCC0 563 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 NLGN3Q9NZ94 848 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 C20orf202A1L168 122 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 ADAP00813 363 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 S100A8P05109 93 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 CSKP41240 450 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 BAGE3Q86Y29 109 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 BAGE2Q86Y30 109 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 LHX5Q9H2C1 402 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 DHDHQ9UQ10 334 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 CRB1P82279 1406 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 FAM159BA6NKW6 160 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 ACKR2O00590 384 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 IFNGR1P15260 489 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 KLRC2P26717 231 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 PDZK1IP1Q13113 114 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 CHRNA6Q15825 494 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 MLIPQ5VWP3 458 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 CEACAM20Q6UY09 585 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 SLC35F3Q8IY50 421 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 OR2M2Q96R28 347 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 DLX3O60479 287 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 NDST3O95803 873 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 SLC25A27O95847 323 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 SOX3P41225 446 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 TRAM2Q15035 370 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 NIPAL3Q6P499 406 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 KCNJ9Q92806 393 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 PYCR2Q96C36 320 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 RAB39BQ96DA2 213 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-216ENST00000545170 TMEM169Q96HH4 297 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms