RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	ATP6V0D1	P61421	351 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	BTG2	P78543	158 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TGFBI	Q15582	683 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CEBPE	Q15744	281 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM156	Q8N614	296 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SERINC2	Q96SA4	455 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	EDAR	Q9UNE0	448 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ASB1	Q9Y576	335 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	PSAT1	Q9Y617	370 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	JMJD1C	Q15652	2540 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CLGN	O14967	610 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNHIT1	O43257	154 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ITGA10	O75578	1167 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ZFAND5	O76080	213 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	B3GALT4	O96024	378 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	IGFBP2	P18065	325 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SAT1	P21673	171 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SERPINB1	P30740	379 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	KCNC1	P48547	511 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	MEOX1	P50221	254 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	MTTP	P55157	894 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	TAS2R39	P59534	338 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	BTN3A2	P78410	334 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	HSF1	Q00613	529 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	LTB	Q06643	244 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC13A2	Q13183	592 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	LAPTM5	Q13571	262 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	PAOX	Q6QHF9	649 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CYS1	Q717R9	158 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	AMER2	Q8N7J2	671 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	OR8K3	Q8NH51	312 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	KIAA1191	Q96A73	305 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	WDR34	Q96EX3	536 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	KCNC2	Q96PR1	638 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	RHBG	Q9H310	441 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	KLHL31	Q9H511	634 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	WWOX	Q9NZC7	414 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CSRP1-213	ENST00000530120	SMIM23	A6NLE4	172 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120		A8MVJ9	347 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	C4orf51	C9J302	202 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	ACOT7	O00154	380 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TP73	O15350	636 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	PEX1	O43933	1283 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	DNAJB6	O75190	326 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	CDH16	O75309	829 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CSRP1-213	ENST00000530120	TPO	P07202	933 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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