RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 C9J4A7 227 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 H7C0S8 307 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 MASP2O00187 686 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 UGT1A9O60656 530 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 SRP72O76094 671 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM63AO94886 807 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 UGT1A6P19224 532 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 UGT1A1P22309 533 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 UGT1A4P22310 534 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ADRA1AP35348 466 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 FOXF2Q12947 444 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 CBFBQ13951 182 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 NCF4Q15080 339 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 SARM1Q6SZW1 724 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 SNX20Q7Z614 316 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 TRABD2AQ86V40 505 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 RAB43Q86YS6 212 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 VSTM4Q8IW00 320 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF398Q8TD17 642 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 GLMPQ8WWB7 406 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 MR1Q95460 341 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 HAUS1Q96CS2 278 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 RMDN2Q96LZ7 410 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 COPS8Q99627 209 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 WWP1Q9H0M0 922 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 MVB12BQ9H7P6 319 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM10Q9UDY6 481 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 RSPH14Q9UHP6 348 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 CREBBPQ92793 2442 aa6.49□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ARGFXA6NJG6 315 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 C2orf74A8MZ97 194 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 E7EQ34 232 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 DNPH1O43598 174 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 AP2A2O94973 939 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 TNFRSF6BO95407 300 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 LCA5LO95447 670 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 TUBB4AP04350 444 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ALPPP05187 535 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 CAPN1P07384 714 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 CYP2A7P20853 494 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 CDH3P22223 829 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 UQCRFS1P47985 274 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 C21orf58P58505 322 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 XIAPP98170 497 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ABRQ12979 859 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC38Q502W7 563 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 CERS6Q6ZMG9 384 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 PID1Q7Z2X4 250 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 OR1L3Q8NH93 324 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 LCN9Q8WX39 176 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 TM9SF4Q92544 642 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.379e-8■■■■■ 68
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PDE4D-222ENST00000514552 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 FICDQ9BVA6 458 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 CDCP1Q9H5V8 836 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ASB8Q9H765 288 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 GPR83Q9NYM4 423 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 CRLS1Q9UJA2 301 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ALG6Q9Y672 507 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ARL5AQ9Y689 179 aa6.48□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.48□□□□□ -1.37
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