RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512153.5

COPB2-208, Transcript of coatomer protein complex subunit beta 2, humanhuman

TSL 4

Gene COPB2, Length 629 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2-208ENST00000512153 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 MFAP3LO75121 409 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 C8GP07360 202 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 SERPINA6P08185 405 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 CYP4B1P13584 511 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 ETS1P14921 441 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 RGS4P49798 205 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 RAB38P57729 211 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 BASP1P80723 227 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 RUNX2Q13950 521 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 VEZF1Q14119 521 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 RCN2Q14257 317 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 MPEG1Q2M385 716 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 CASC4Q6P4E1 433 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 CENPUQ71F23 418 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 PRUNE1Q86TP1 453 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 SLC2A12Q8TD20 617 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 PAQR8Q8TEZ7 354 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 KCNJ9Q92806 393 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 FAM111AQ96PZ2 611 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 PRDM14Q9GZV8 571 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 KLHL28Q9NXS3 571 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 ARL15Q9NXU5 204 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 PAK5Q9P286 719 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 USF3Q68DE3 2245 aa9.76□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 DSCAMO60469 2012 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 ABCA1O95477 2261 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 LRRC3CA6NJW4 275 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 RNF223E7ERA6 249 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 DYRK3O43781 588 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 CTNSO60931 367 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 LRATO95237 230 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 C1QAP02745 245 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 SMIM10L1P0DMW3 83 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 SERPINB3P29508 390 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 GCKP35557 465 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 MSH2P43246 934 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 MASP1P48740 699 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 FOXF2Q12947 444 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 CTBP1Q13363 440 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 SNX1Q13596 522 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.856e-7■■■□□ 16.7
COPB2-208ENST00000512153 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 DUPD1Q68J44 220 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 ZNF470Q6ECI4 717 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 VASNQ6EMK4 673 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 UGT3A1Q6NUS8 523 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 CNGA4Q8IV77 575 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 C9orf106Q8NAJ2 232 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 DIO2Q92813 273 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 SMIM10Q96HG1 83 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 ZNF597Q96LX8 424 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 TSNARE1Q96NA8 513 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 TM9SF2Q99805 663 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 KIFC1Q9BW19 673 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 PIGMQ9H3S5 423 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 SYBUQ9NX95 663 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 AMFRQ9UKV5 643 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 NINQ8N4C6 2090 aa9.75□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 A0A087X1B8 175 aa9.74□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9.74□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 ERI3O43414 337 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
COPB2-208ENST00000512153 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms