RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490540.1

ASIC3-208, Transcript of acid sensing ion channel subunit 3, human

TSL 2

Gene ASIC3, Length 520 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC3-208	ENST00000490540	ECHS1	P30084	290 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PTGER1	P34995	402 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SSR4	P51571	173 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	RAP1GDS1	P52306	607 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	KRTAP10-9	P60411	292 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	RPTN	Q6XPR3	784 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	IFT81	Q8WYA0	676 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540		A0A0G2JMM0	328 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540		A0A1W2PPB8	328 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540		A0A1W2PRS3	328 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PINLYP	A6NC86	204 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	C17orf105	B2RV13	164 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540		G3V3Y1	287 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	C19orf84	I3L1E1	186 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PLPP1	O14494	284 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PEX1	O43933	1283 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	HS6ST1	O60243	411 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	KLK8	O60259	260 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	EED	O75530	441 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	OR6B1	O95007	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SCEL	O95171	688 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ETHE1	O95571	254 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	MLYCD	O95822	493 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ABO	P16442	354 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SERPINB1	P30740	379 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SOX3	P41225	446 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	NEK2	P51955	445 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	HK2	P52789	917 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CASP6	P55212	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PCDH1	Q08174	1060 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SLAMF1	Q13291	335 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	GTF2H2	Q13888	395 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	RCN2	Q14257	317 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ACAP2	Q15057	778 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CDSN	Q15517	529 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	C18orf63	Q68DL7	685 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	MTFR2	Q6P444	385 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	KLC3	Q6P597	504 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CHSY3	Q70JA7	882 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CDK15	Q96Q40	435 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	RASL10B	Q96S79	203 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	PAFAH2	Q99487	392 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	IPPK	Q9H8X2	491 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	DEPP	Q9NTK1	212 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	SPACA6	W5XKT8	324 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		11.13	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	GLOD5	A6NK44	160 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540		A8MVJ9	347 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	HRK	O00198	91 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	OR7A17	O14581	309 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ASIC3-208	ENST00000490540	INHBA	P08476	426 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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