RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 MED16Q9Y2X0 877 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 MTORP42345 2549 aa6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 PCM1Q15154 2024 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 DYTNA2CJ06 578 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 E7ENX8 843 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 E7EVH7 732 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 H3BMM5 538 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 GFYI3L273 518 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 AP3B1O00203 1094 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 MAP2K7O14733 419 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 NIPSNAP2O75323 286 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 NDUFS3O75489 264 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 PRKD3O94806 890 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 WDPCPO95876 746 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 CELA2AP08217 269 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 CYC1P08574 325 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 ITGAMP11215 1152 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 FBLP22087 321 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 MGAT1P26572 445 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 MST1P26927 711 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 ECHS1P30084 290 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 CMPK1P30085 196 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 FMO4P31512 558 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 HSD17B2P37059 387 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGEA6P43360 314 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNK10P57789 538 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 CDK16Q00536 496 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 TAP2Q03519 686 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 SNX1Q13596 522 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM53BQ14153 422 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 ADRM1Q16186 407 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 HKDC1Q2TB90 917 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 MRNIPQ6NTE8 343 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 H3F3CQ6NXT2 135 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 SUSD1Q6UWL2 747 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 CES3Q6UWW8 571 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF627Q7L945 461 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 FJX1Q86VR8 437 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 PRSS58Q8IYP2 241 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 RAB42Q8N4Z0 105 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 CNDP1Q96KN2 507 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 FOPNLQ96NB1 174 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 PKP4Q99569 1192 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 DESI2Q9BSY9 194 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 ACAT2Q9BWD1 397 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 ABI3Q9P2A4 366 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 PTGFRNQ9P2B2 879 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 TRPC4Q9UBN4 977 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 ZGRF1Q86YA3 2104 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A087X1B8 175 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 TXNDC9O14530 226 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 P2RX6O15547 441 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 ABHD16AO95870 558 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC16A8O95907 504 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 HEXBP07686 556 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 ICAM2P13598 275 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 EZRP15311 586 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 TPSB2P20231 275 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 CHRM3P20309 590 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 OGNP20774 298 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 CXCR2P25025 360 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNJ1P48048 391 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 PNLIPRP1P54315 467 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 ARG2P78540 354 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 ABATP80404 500 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 NHLH2Q02577 135 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNJ11Q14654 390 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 TPSAB1Q15661 275 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 SYT16Q17RD7 645 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 TIGD2Q4W5G0 525 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 SEL1L2Q5TEA6 688 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 ICE2Q659A1 982 aa5.99□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 PLAG1Q6DJT9 500 aa5.99□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms